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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001777`

染色体: Chr06 坐标: 20797095-20804250 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001777`
名称	SmilChr06G001777
描述	uncharacterized SmilChr06G001777
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	20797095 - 20804250 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987424`
GeneID	`130987424`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987424`
原始查询	`LOC130987424`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF09331 (DUF1985); PF29561 (DUF8566)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987424

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057766938.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057766939.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.60000	`XP_057766939.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766938.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766938.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:20801730`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	30	A10,A7,B135,B2,B25,B27,B33,B38,B39,B41,B44,B51,B76,B78,B91,C18,C31,C37,C4,C51,C55,C57,C6,C62,C73,C74,C78,C8,D10,D9
`Chr6:20801738`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	22	A18,A9,B1,B100,B103,B120,B27,B30,B47,B57,B68,B73,B99,C13,C30,C44,C5,C59,C60,C71,C75,D1
`Chr6:20801755`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:20801766`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,C49
`Chr6:20801821`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C34
`Chr6:20801862`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,B82
`Chr6:20801894`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr6:20801913`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:20801962`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,D5
`Chr6:20801986`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,B61,B78,B84
`Chr6:20802051`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B126,C35
`Chr6:20802059`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C22

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766938.1

430 aa

215

430

DUF1985

DUF8566

PF09331 DUF1985 77-212 aa PF29561 DUF8566 82-234 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766938.1`	Pfam	`PF09331`	DUF1985	Family	77	212	2.7e-15	57.3	Domain of unknown function (DUF1985)
`XP_057766938.1`	Pfam	`PF29561`	DUF8566	Domain	82	234	7.9e-11	42.8	Domain of unknown function (DUF8566)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009089727.1
AACAATAATAAAAGGTACACTGAAGTGGCAGGGAGTATCATGCGTGTCAGGTAGGAAATTTATGACCAAATTTATTGGGTTTAGAAATAGGTTGGTAGAATTGTCTTTATTATGTCCAACCAATTCTCTCCAATTATGCGCCCCTCCCCAATTCTACCTATGCGGAAATTCTCTCTCTCTCTGCGGAACAAATCTCTCTATGCGCCCCTCCCCAATTCTCTCTCTACGGAACAAATCTCTCTCTCTGTCCAACCCTTTTT...

XM_057910956.1
TTCCCCTTAAACAATAATAAAAGGTACACTGAAGTGGCAGGGAGTATCATGCGTGTCAGGTAGGAAATTTATGACCAAATTTATTGGGTTTAGAAATAGGTTGGTAGAATTGTCTTTATTATGTCCAACCAATTCTCTCCAATTATGCGCCCCTCCCCAATTCTACCTATGCGGAAATTCTCTCTCTCTCTGCGGAACAAATCTCTCTATGCGCCCCTCCCCAATTCTCTCTCTACGGAACAAATCTCTCTCTCTGTCCA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130987424
ATGGACCAACCGGATGAGGGTCCTCCTATTTTGTTGAGACCGGACACAATTAATTCAACGTGGGACGTTGGCACATATTATAAAATAAAGTATCTTAGCAAGGTTGTCGGTAAATGTGTGGCGGAGTTTGCGCACCCCCGATGCTTAAAGTGGAAGTTTCGGAGTCGACCTTCTACAAATGAGTTACACCCATTCTTCGAGAAAGAGGAGCAACAAATATTGGAGCTTCAACCAGATGAATTTGAACTGACGACCATGTA...

LOC130987424
ATGGACCAACCGGATGAGGGTCCTCCTATTTTGTTGAGACCGGACACAATTAATTCAACGTGGGACGTTGGCACATATTATAAAATAAAGTATCTTAGCAAGGTAAAATCTGTTTTGAAGGAAAAAGGTGGTCAACAGTTATTAGATAGATTTATAGGGGGTTGTTTTGGACATTTTTTGGATTGGAATCCTAGTCCGAAATGTGCAATGGCCGTGCATCATGTGGTATCCCGCCAAATAAAATCAGATAATAATGATCT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057766938.1
MDQPDEGPPILLRPDTINSTWDVGTYYKIKYLSKVKSVLKEKGGQQLLDRFIGGCFGHFLDWNPSPKCAMAVHHVVSRQIKSDNNDLCFKLNNTKVYLSRRDYALVTGLQFGDFNYDMSRNHNLDEVEVFRRFSGGQSHVKVSFLVDLFYNFKINDEDGSLHLKIAYIIVLYGLLVGYETDKTVEHWVWALVDDLDKFNRFPWGAYSYNLLCHHAGKIFTSKKQYKFYGPVWALHVWSLEVMPDLGQVVGKCVAEFAHPR...

XP_057766939.1
MDQPDEGPPILLRPDTINSTWDVGTYYKIKYLSKVVGKCVAEFAHPRCLKWKFRSRPSTNELHPFFEKEEQQILELQPDEFELTTMYYLSTLGFDLGRPGEEDDNQEEEPHPSGSLNDIYRARHEKTPDLLFDAPIETHEVSTLHDTPIGVEDIPWTGTDRRLGVHRPAMVLVEFVLCWLSCLLGVGIVHILLPIEVVTSCLSSFVRNIRKHGHILF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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