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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001762`

染色体: Chr06 坐标: 20592470-20594707 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001762`
名称	SmilChr06G001762
描述	uncharacterized SmilChr06G001762
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	20592470 - 20594707 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987427`
GeneID	`130987427`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987427`
原始查询	`LOC130987427`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mediator of RNA polymerase II transcription subunit-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831617]; symbol=AT5G17510; hit=AT5G17510; species=arabidopsis; confidence=high
产物	mediator of RNA polymerase II transcription subunit-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831617]; symbol=AT5G17510; hit=AT5G17510; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G17510` (AT5G17510) mediator of RNA polymerase II transcription subunit-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831617] identity=68.7; qcov=0.688; evalue=7.07e-114; confidence=high
Rice	`Os12g0465700` (DEC) - identity=57.6; qcov=0.688; evalue=2.85e-87; confidence=high
GO	GO:0016514 (SWI/SNF complex); GO:0045893 (positive regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF15249 (GLTSCR1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987427

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057766947.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766947.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766947.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057766947.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057766947.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:20593960`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B61,D10
`Chr6:20593993`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr6:20594107`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766947.1

353 aa

176

353

GLTSCR1

PF15249 GLTSCR1 118-232 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766947.1`	Pfam	`PF15249`	GLTSCR1	Family	118	232	1.2e-27	97.1	Conserved region of unknown function on GLTSCR protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910964.1
TGCCACTCTAGCTAAGCCCATTTATAAATGCCCCAAGGCCCAAAAAAGCAAGAAACTTCTCTCTCCTCTCTCTTGAAGAAATTGCTTTCTTCTCCGGCGTGATGAATGATTATTAGTCAAGTAAAATGGGGCATAGGTGGTGGTAGCTCATTACAATGGAAGACAACAAGGCGGCGATGGCGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAATTGTTGCAGCAACAGCTGCTGATGCAGCAGATCCAAAGGCAGAAGGACGCCATGTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987427
ATGGAAGACAACAAGGCGGCGATGGCGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAATTGTTGCAGCAACAGCTGCTGATGCAGCAGATCCAAAGGCAGAAGGACGCCATGTCCCGGTTCCCCTCCAACATCGACGCCCATCTCCGCCCACAGGGTCAGGGTCAGGCTCAGCACCCCTCTCTTCTTCACCCCCGCCCTCTCACAAACCCTAATCCTAATTCCGCTCCCCAACAACCGAATCAGCTCCATCCCAACCCCAACCCTAACCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766947.1
MEDNKAAMAQQQQQQQLLQQQLLMQQIQRQKDAMSRFPSNIDAHLRPQGQGQAQHPSLLHPRPLTNPNPNSAPQQPNQLHPNPNPNPNPNSSSAPTTNIAMSQQQQQHKASLQLAYQDAWRVCHPDFKRPFSSLEDACERLLPYHVVADYEAEEDDKILDSATTGQILSRSQQWDNNIAAKVAEFTATFEKQVLAFNIISRKRGLGEFRTEEKLMMEQFLLQEEKRSLLELRAEMDSRQKASRESHEANMRMAAMAHVDH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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