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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001796`

染色体: Chr06 坐标: 21068920-21071429 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001796`
名称	SmilChr06G001796
描述	glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, cytosolic-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	21068920 - 21071429 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987428`
GeneID	`130987428`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987428`
原始查询	`LOC130987428`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, cytosolic-like
产物	glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase%2C cytosolic-like
Arabidopsis	`AT1G13440` (GAPC2) glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase C2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837904] identity=88.9; qcov=0.985; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0486600` (GAPDH) - identity=90.4; qcov=0.988; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0006006 (glucose metabolic process); GO:0016620 (oxidoreductase activity, acting on the aldehyde or oxo group of donors, NAD or NADP as acceptor); GO:0050661 (NADP binding); GO:0051287 (NAD binding)
KEGG	smil00010 (Glycolysis / Gluconeogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00710 (Carbon fixation by Calvin cycle - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01200 (Carbon metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01230 (Biosynthesis of amino acids - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00044 (Gp_dh_N); PF02800 (Gp_dh_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987428

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057766949.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057766949.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766949.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766949.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766949.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:21069665`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr6:21070020`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr6:21070219`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B108,B2,B33,C14
`Chr6:21070485`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr6:21070517`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr6:21070530`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr6:21070536`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr6:21070718`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B26,C36,C40,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766949.1

337 aa

168

337

Gp_dh_N

Gp_dh_C

PF00044 Gp_dh_N 4-106 aa PF02800 Gp_dh_C 153-318 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766949.1`	Pfam	`PF00044`	Gp_dh_N	Domain	4	106	1.8e-33	115.6	Glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase, NAD binding domain
`XP_057766949.1`	Pfam	`PF02800`	Gp_dh_C	Domain	153	318	1.5e-75	253.3	Glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910966.1
TTTCTACTACTATAAATACACACACTACTCAACCCTACTGCCTGCATAATCTCTCCTTCAATCTCATTTTACTATCTTCCATATATTGTTTACTCTCTCTCTCTCACTCTCTGTTTTCTTCATCATGGCCAAGATCAAGATCGGAATCAATGGATTCGGAAGGATTGGGCGTTTGGTCGCCAGAGTTGCCCTATTGAGTGATGATGTTGAGTTAGTCGCTGTTAACGATCCATTTATCACCACTGATTACATGACATACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987428
ATGGCCAAGATCAAGATCGGAATCAATGGATTCGGAAGGATTGGGCGTTTGGTCGCCAGAGTTGCCCTATTGAGTGATGATGTTGAGTTAGTCGCTGTTAACGATCCATTTATCACCACTGATTACATGACATACATGTTCAAATACGACAGTGTTCACGGTCCATGGAAAAAGCATGAGCTGAAGGTTAAGGATTCCAAGACCTTGCTCTTTGGTGACAGGCCTGTGACTGTATTTGGCATGAGGAACCCCGAGGAAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766949.1
MAKIKIGINGFGRIGRLVARVALLSDDVELVAVNDPFITTDYMTYMFKYDSVHGPWKKHELKVKDSKTLLFGDRPVTVFGMRNPEEIPWGQAGAEYVVESTGVFTDQDKAAAHLKGGAKKVIISAPSKDAPMFVVGVNEKEYKKDINIVSNASCTTNCLAPLAKVINDKFGIVEGLMTTVHSITATQKTVDGPSMKDWRGGRAASFNIIPSSTGAAKAVGKVLPALNGKLTGMAFRVPTVDVSVVDLTARLEKAASYDEI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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