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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001776`

染色体: Chr06 坐标: 20788816-20791116 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001776`
名称	SmilChr06G001776
描述	uncharacterized SmilChr06G001776
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	20788816 - 20791116 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987432`
GeneID	`130987432`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987432`
原始查询	`LOC130987432`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Thioredoxin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831274]; symbol=AT5G14240; hit=AT5G14240; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Thioredoxin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831274]; symbol=AT5G14240; hit=AT5G14240; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G14240` (AT5G14240) Thioredoxin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831274] identity=72.9; qcov=0.996; evalue=2.54e-123; confidence=high
Rice	`Os01g0184800` - identity=71.2; qcov=0.968; evalue=1.07e-112; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006457 (protein folding)
KEGG	-
Pfam	PF02114 (Phosducin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987432

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057766956.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057766956.1`
3	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057766956.1`
4	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057766956.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766956.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:20789092`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr6:20789152`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr6:20789173`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B108,B2,B33,C14
`Chr6:20789871`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,B96,C85
`Chr6:20789903`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr6:20789907`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr6:20789917`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr6:20790830`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr6:20790846`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766956.1

248 aa

124

248

Phosducin

PF02114 Phosducin 55-177 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766956.1`	Pfam	`PF02114`	Phosducin	Domain	55	177	1.5e-15	57.6	Phosducin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910973.1
GAAAAAAATATACATAACGGATGGAGTTATGTAGTGGTTTCGAAAATTTGGGGCATTTAAAAAGATTGGGCCACACTCAGACTCAGGTGAGGTGGTAAAGAAAATTAAAATCTTATACAACTGCTGAATAAAGTGGGCGGGGGAGCTGCGAAGATCCACATCAATGGCGGATTACCATTTCGTGTACAAGGATTTGGAAGGGGCTTCCACGCAATGGGACGATATTCAGAGGAAACTCGGAAATCTGCCGGAGAAGGCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987432
ATGGCGGATTACCATTTCGTGTACAAGGATTTGGAAGGGGCTTCCACGCAATGGGACGATATTCAGAGGAAACTCGGAAATCTGCCGGAGAAGGCGCCGGTATTCAAGCCGCCGTCTTTCACCCCGGCCGAGGACGAGGATTCCAAGCCCAAGAATAGGACCTGGATCGACGGCAAAACCGAGGAGGAGCTTGAAGATCTCGAAGATGATCTCGACGATGATCGCTTCCTCGAGGAGTACAGGAAGAAAAGGTTGGTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766956.1
MADYHFVYKDLEGASTQWDDIQRKLGNLPEKAPVFKPPSFTPAEDEDSKPKNRTWIDGKTEEELEDLEDDLDDDRFLEEYRKKRLVEMREAAKIAKFGSVIPISGSDFVREVSQAPQDVWVVVLLYKDGFPECRVLLQCLEDLAKRYPATKFVKIISTECIPNYPDRNLPTVLVYNNSAVKATHTGIHSFGRRCTSESVALVLCQSDPVLNDGHGGEQSRDAVLDGVRKKFLERVVREREDDDGSSSD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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