Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001794`

染色体: Chr06 坐标: 21031116-21032973 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001794`
名称	SmilChr06G001794
描述	uncharacterized SmilChr06G001794
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	21031116 - 21032973 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987435`
GeneID	`130987435`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987435`
原始查询	`LOC130987435`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0421700; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os04g0421700; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os04g0421700` - identity=30.56; qcov=0.581; evalue=7.87e-09; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987435

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057766959.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:21031336`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,B85,B96
`Chr6:21031404`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr6:21031407`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	D9
`Chr6:21031407`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	D9
`Chr6:21031408`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	D9
`Chr6:21031408`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	D9
`Chr6:21031631`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,C82
`Chr6:21031632`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,C82
`Chr6:21031639`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B89,C73
`Chr6:21031695`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr6:21031709`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C34
`Chr6:21031709`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C34

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910976.1
TTGAGCAGGAGTGGTATAAATCTCATGATTCTAGTTTGGAATGCTTTGATGACAATGGGTTAGTGGTGAAATATAAAATTACCCCACACAATAAGATTCATCACCATATTGTTACATTTGATTCCTCAAGTGAAAAAAGTAGCTGTAGTTGCAGAAAGTTTGAATTTGCTGGGATTCTGTGTTCTCATATTTTGAAGGTATTCACCATGAAAAATGTTATGAAAATCTCATGTGAATACATCATGAAAAGATGGACACGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080392.1_cds_XP_057766959.1_32666
ATGAAAAATGTTATGAAAATCTCATGTGAATACATCATGAAAAGATGGACACGACAAGCAAAAGTTGGATTTATTGGAGATTCGAATCTCAATAAATTCAACTCGGATCCAAAAAATATGCTTCAAAATCTACGATATAGAGAATTATGTGGGTTGTATGTTCAGTTGGTTACAAAAGCTTCTGAGGATGAAGATACTTACAGAATTGTAAAAGATGGTATTTTGAAGATGTTTGATATGGTGGATAGTAGATTTCAAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766959.1
MKNVMKISCEYIMKRWTRQAKVGFIGDSNLNKFNSDPKNMLQNLRYRELCGLYVQLVTKASEDEDTYRIVKDGILKMFDMVDSRFQGQELDQHGDGTSLLLNEAQMQTNERNTCGAKGIKSKNKTTSGKRLRGGLENGSRKKKVGRKKVQRLSSDNLEGVQGNHDIVSDVPSVSYQGVNEIQDFSASSSHQNFGGSPSMSMTSLLLAQQPLGFGPFQTHNSQQSINVDK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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