当前解析结果
SmilChr06G001772| 统一新 Gene ID | SmilChr06G001772 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G001772 |
| 描述 | formin-like protein 3 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 20743066 - 20746884 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130987443 |
|---|---|
| GeneID | 130987443 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130987443 |
| 原始查询 | LOC130987443 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | formin-like protein 3 |
| 产物 | formin-like protein 3 |
| Arabidopsis | AT1G31810 (AFH14)Formin Homology 14 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840068] identity=60.7; qcov=0.636; evalue=8.05e-16; confidence=low |
| Rice | Os10g0119300 (OsFH3)- identity=64.3; qcov=0.636; evalue=1.64e-16; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130987443 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057766968.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057766968.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057766968.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057766968.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057766968.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:20744774 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B104,D11 |
Chr6:20744784 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B104,D11 |
Chr6:20744792 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B24 |
Chr6:20744795 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C4 |
Chr6:20744807 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A10,B24 |
Chr6:20746212 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B106,B9,C40,C9 |
Chr6:20746238 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | B106,C9 |
Chr6:20746238 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B106,C9 |
Chr6:20746244 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B35,C15,C52 |
Chr6:20746309 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B43 |
Chr6:20746435 |
GT |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 8 | A1,B106,B28,C24,C29,C76,C84,D8 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
3 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。