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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001831`

染色体: Chr06 坐标: 21498672-21501452 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001831`
名称	SmilChr06G001831
描述	small ribosomal subunit biogenesis GTPase RsgA 1, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	21498672 - 21501452 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987474`
GeneID	`130987474`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987474`
原始查询	`LOC130987474`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	small ribosomal subunit biogenesis GTPase RsgA 1, mitochondrial
产物	small ribosomal subunit biogenesis GTPase RsgA 1%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT1G67440` (emb1688) Minichromosome maintenance (MCM2/3/5) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843064] identity=50.3; qcov=1.22; evalue=5.21e-142; confidence=high
Rice	`Os04g0381600` - identity=74; qcov=0.39; evalue=3.53e-80; confidence=low
GO	GO:0003924 (GTPase activity); GO:0005525 (GTP binding)
KEGG	smil00730 (Thiamine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03193 (RsgA_GTPase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987474

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057766990.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.20000	`XP_057766990.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766991.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766991.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766991.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:21500014`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B21,B24,B4,B98,C41
`Chr6:21501184`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C71
`Chr6:21501184`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766990.1

479 aa

240

479

RsgA_GTPase

PF03193 RsgA_GTPase 153-339 aa

XP_057766991.1

405 aa

202

405

RsgA_GTPase

PF03193 RsgA_GTPase 153-214 aa PF03193 RsgA_GTPase 223-265 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766990.1`	Pfam	`PF03193`	RsgA_GTPase	Domain	153	339	9.1e-50	169.6	RsgA GTPase
`XP_057766991.1`	Pfam	`PF03193`	RsgA_GTPase	Domain	153	214	9.9e-27	94.6	RsgA GTPase
`XP_057766991.1`	Pfam	`PF03193`	RsgA_GTPase	Domain	223	265	9.9e-27	94.6	RsgA GTPase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911007.1
AGCTCGAGTTCGATAAATAGACGACGAGTCGGCAATAAAATAGAGGTTCGAATCGGGCTCAAAACCGGAGTTCGAGTTTACTGGCATTCGCTCGGCTCGTTTAGCGTATAATGATAATAATAATTGCTGTTTTGCCGGAAAATTCCAGAAGTTGAATTATTCGATAATCCGTTTTCTCCACTCTCACAGTCTCGAGTTCTCTCTCTCTCCATATTCATCTTCAAAATTCTCTGTTTTCTTCATGCATCCGCCATGACCAT...

XM_057911008.1
GGTTCGAATCGGGCTCAAAACCGGAGTTCGAGTTTACTGGCATTCGCTCGGCTCGTTTAGCGTATAATGATAATAATAATTGCTGTTTTGCCGGAAAATTCCAGAAGTTGAATTATTCGATAATCCGTTTTCTCCACTCTCACAGTCTCGAGTTCTCTCTCTCTCCATATTCATCTTCAAAATTCTCTGTTTTCTTCATGCATCCGCCATGACCATCGCATCAATTTCAGTTCTCCGCCAGAAGCTACCGCCATTCCTCT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130987474
ATGACCATCGCATCAATTTCAGTTCTCCGCCAGAAGCTACCGCCATTCCTCTCCACGGCGTTCATCCACCAGCAGCGCTTCATCTCCGCCGTTCAAAACCCTATCAATGCCAGAAAGCAGCAGCAGCAGAAGCAGCATCAACCGAACAAAAACGTGCTCAGAGCTCGAGAGACCTTCAAAAAGCAGTTCTCCTCCCTGGCGCCGCTCCTCTCCCCCGACGAGAAGCCGCCACTGACGGATAATCAGGCGATCGGCACGGT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057766990.1
MTIASISVLRQKLPPFLSTAFIHQQRFISAVQNPINARKQQQQKQHQPNKNVLRARETFKKQFSSLAPLLSPDEKPPLTDNQAIGTVVSSQANFMRVVVNSASQSEDWGSLGMELLCVVKEVLKKIKRRVLVGDRVLVGAIDWVDKGGRIENVFERKSEILDPPVANVDHLLVLFSIEQPTIEPFTLTRFLVEAESTGIPLTLALNKVELAEEGTLKEWKSRLRHWGYEPVFCSVDTKQGLDTLQFILREQTSVIVGPSG...

XP_057766991.1
MTIASISVLRQKLPPFLSTAFIHQQRFISAVQNPINARKQQQQKQHQPNKNVLRARETFKKQFSSLAPLLSPDEKPPLTDNQAIGTVVSSQANFMRVVVNSASQSEDWGSLGMELLCVVKEVLKKIKRRVLVGDRVLVGAIDWVDKGGRIENVFERKSEILDPPVANVDHLLVLFSIEQPTIEPFTLTRFLVEAESTGIPLTLALNKVELAEEGTLGSKWFEEQRVGEVSTRSGRGKHTTRNVSLLPLSGGGYLADTPGF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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