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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001834`

染色体: Chr06 坐标: 21535941-21538858 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001834`
名称	SmilChr06G001834
描述	uncharacterized SmilChr06G001834
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	21535941 - 21538858 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987476`
GeneID	`130987476`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987476`
原始查询	`LOC130987476`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ATP12 protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834066]; symbol=AT5G40660; hit=AT5G40660; species=arabidopsis; confidence=high
产物	ATP12 protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834066]; symbol=AT5G40660; hit=AT5G40660; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G40660` (AT5G40660) ATP12 protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834066] identity=63.4; qcov=1.04; evalue=1.56e-145; confidence=high
Rice	`Os07g0644000` (OJ1003_C06.132) - identity=74.1; qcov=0.775; evalue=1.5e-134; confidence=high
GO	GO:0005739 (mitochondrion); GO:0033615 (mitochondrial proton-transporting ATP synthase complex assembly)
KEGG	-
Pfam	PF07542 (ATP12)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987476

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057766994.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766994.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766994.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766994.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057766994.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:21536051`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B23,B37,B58,C80
`Chr6:21536051`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B23,B37,B58,C80
`Chr6:21536077`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B140,B26,C36,C40,C8
`Chr6:21536085`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B126,D7
`Chr6:21536100`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B77,C18,C63
`Chr6:21536111`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C34
`Chr6:21536112`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B17,B77,C20
`Chr6:21536126`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr6:21536129`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	25	A15,A19,A4,A7,B113,B13,B136,B21,B24,B34,B37,B42,B43,B58,B65,B78,B82,B98,C38,C47,C49,C5,C80,C85,D11
`Chr6:21536191`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr6:21536192`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B12,B137,B16,B55,C2
`Chr6:21536195`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	29	A1,A3,A4,B101,B124,B126,B129,B29,B3,B30,B45,B58,B67,B69,B8,B87,B88,B89,C10,C24,C38,C39,C41,C44,C55,C71,C72,C9,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766994.1

324 aa

162

324

ATP12

PF07542 ATP12 86-211 aa

XP_057766995.1

324 aa

162

324

ATP12

PF07542 ATP12 86-211 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766994.1`	Pfam	`PF07542`	ATP12	Family	86	211	3.5e-31	108.6	ATP12 chaperone protein
`XP_057766995.1`	Pfam	`PF07542`	ATP12	Family	86	211	3.5e-31	108.6	ATP12 chaperone protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XR_009089765.1
CATACACACACGCACGCTGTCTCTTTCTATCGAAGTATCAGTCTATCCCTCTCTCCCCGACCGCGAAAATGGCGTCATGGTTGGTGGGGAGTACCCTGAAAACCCTAAGTTCCTCCACTCTCAGAACCCTCACCTCCGCCGGGCGCCGCCTCAGCGTCGCGGCAGCAGCCGGAGACTCCGAAAACGAACAGTCATCATTCACCTTCTCCTCCGAAGATCCGAAACCCGCCGGCGGAGACGACACAATATACGTGCAGGGG...

XR_009089764.1
CATACACACACGCACGCTGTCTCTTTCTATCGAAGTATCAGTCTATCCCTCTCTCCCCGACCGCGAAAATGGCGTCATGGTTGGTGGGGAGTACCCTGAAAACCCTAAGTTCCTCCACTCTCAGAACCCTCACCTCCGCCGGGCGCCGCCTCAGCGTCGCGGCAGCAGCCGGAGACTCCGAAAACGAACAGTCATCATTCACCTTCTCCTCCGAAGATCCGAAACCCGCCGGCGGAGACGACACAATATACGTGCAGGGG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130987476
ATGGCGTCATGGTTGGTGGGGAGTACCCTGAAAACCCTAAGTTCCTCCACTCTCAGAACCCTCACCTCCGCCGGGCGCCGCCTCAGCGTCGCGGCAGCAGCCGGAGACTCCGAAAACGAACAGTCATCATTCACCTTCTCCTCCGAAGATCCGAAACCCGCCGGCGGAGACGACACAATATACGTGCAGGGGCGGAAAAAGGCGTCCGATTCCGTGAGCATGCCGCTGTCGTTCATGACCGGCTCGATCGTCGGAAAGCG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057766994.1
MASWLVGSTLKTLSSSTLRTLTSAGRRLSVAAAAGDSENEQSSFTFSSEDPKPAGGDDTIYVQGRKKASDSVSMPLSFMTGSIVGKRFYKEVTTREADDGIGWSVMLDYRTLKSPSKRNLKCPTLALAKAIAAEWEYQQTDGIRPFTMPLMKLTCTALERVPVTRPKIIENLMQKFHQDLVFCRAPRDNDVTRDLRELQVEKFGPLIKWVELEFGFKPAVYTSFFGGKQEEGLVKAFENILKKTDDCELAAIDAIAAAAH...

XP_057766995.1
MASWLVGSTLKTLSSSTLRTLTSAGRRLSVAAAAGDSENEQSSFTFSSEDPKPAGGDDTIYVQGRKKASDSVSMPLSFMTGSIVGKRFYKEVTTREADDGIGWSVMLDYRTLKSPSKRNLKCPTLALAKAIAAEWEYQQTDGIRPFTMPLMKLTCTALERVPVTRPKIIENLMQKFHQDLVFCRAPRDNDVTRDLRELQVEKFGPLIKWVELEFGFKPAVYTSFFGGKQEEGLVKAFENILKKTDDCELAAIDAIAAAAH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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