当前解析结果
SmilChr06G001860| 统一新 Gene ID | SmilChr06G001860 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G001860 |
| 描述 | RNA-binding protein Y14A-like |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 22031982 - 22033319 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130987503 |
|---|---|
| GeneID | 130987503 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130987503 |
| 原始查询 | LOC130987503 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | RNA-binding protein Y14A-like |
| 产物 | RNA-binding protein Y14A-like |
| Arabidopsis | AT1G51510 (Y14)RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841576] identity=66.2; qcov=0.916; evalue=1.56e-55; confidence=high |
| Rice | Os05g0140500 (OsY14a)- identity=71.9; qcov=0.574; evalue=1.73e-39; confidence=medium |
| GO | GO:0003729 (mRNA binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0008380 (RNA splicing); GO:0035145 (exon-exon junction complex) |
| KEGG | smil03013 (Nucleocytoplasmic transport - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03015 (mRNA surveillance pathway - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)) |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130987503 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057767026.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057767026.1 |
| 3 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057767026.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057767026.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057767026.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:22032119 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B21,B98 |
Chr6:22032188 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B21 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。