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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001878`

染色体: Chr06 坐标: 22370296-22374015 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001878`
名称	SmilChr06G001878
描述	cytochrome P450 724B1
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	22370296 - 22374015 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987520`
GeneID	`130987520`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987520`
原始查询	`LOC130987520`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cytochrome P450 724B1
产物	cytochrome P450 724B1
Arabidopsis	`AT5G14400` (CYP724A1) cytochrome P450, family 724, subfamily A, polypeptide 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831291] identity=51.9; qcov=0.913; evalue=2.72e-165; confidence=high
Rice	`Os04g0469800` (D11) - identity=54; qcov=0.955; evalue=1.44e-177; confidence=high
GO	GO:0004497 (monooxygenase activity); GO:0005506 (iron ion binding); GO:0016125 (sterol metabolic process); GO:0016705 (oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen); GO:0020037 (heme binding)
KEGG	smil00905 (Brassinosteroid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00067 (p450)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987520

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057767041.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057767041.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767041.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767041.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767041.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:22370709`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B90,B92
`Chr6:22370709`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr6:22370715`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B27,B57
`Chr6:22370715`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B27,B57
`Chr6:22370717`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C82,D4
`Chr6:22370721`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr6:22370767`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	173	A1,A10,A11,A13,A15,A16,A18,A19,A2,A20,A22,A24,A25,A3,A6,B10,B101,B102,B103,B104,B105,B106,B107,B109,B11,B110,B113,B115,B117,B118,B119,B121,B122,B125,B126,B129,B13,B130,B132,B134,B135,B136,B138,B139,B14,B140,B15,B17,B19,B20,B21,B22,B24,B25,B29,B3,B32,B34,B35,B37,B38,B39,B40,B41,B42,B43,B45,B46,B48,B49,B50,B52,B53,B55,B56,B58,B59,B60,B62,B63,B64,B66,B67,B68,B69,B7,B70,B72,B73,B74,B75,B76,B77,B79,B8,B80,B81,B83,B84,B85,B86,B89,B9,B90,B92,B93,B94,B95,B97,B98,B99,C10,C12,C13,C15,C16,C17,C18,C19,C22,C25,C27,C29,C3,C30,C31,C32,C33,C34,C35,C38,C39,C4,C41,C42,C43,C44,C45,C48,C49,C51,C52,C53,C55,C56,C58,C59,C6,C60,C61,C63,C65,C68,C7,C70,C72,C73,C75,C76,C77,C78,C8,C80,C81,C86,C87,C9,D1,D10,D11,D2,D5,D7
`Chr6:22370850`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	1	D7
`Chr6:22370850`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	D7
`Chr6:22370851`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	D7
`Chr6:22370851`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	D7
`Chr6:22371854`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767041.1

471 aa

236

471

p450

PF00067 p450 42-452 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767041.1`	Pfam	`PF00067`	p450	Domain	42	452	4e-60	204.6	Cytochrome P450

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911058.1
GGATGTTACTCATGAGAGCTGCAGAATAAAAATGGCTGCATTTTTGGTTGTGATTCTCACTCTCTTTTTAGGAATTGCTATTTTATTTAAACTTTTTGGCATCTCCATTTTCAAAGAAAATCCTGCAGGCTTACCTGATGGAAGCATGGGGCATTTCCCTTTCCTTGGTGAAACTCTTGCCTATCTCAAACCTCATAAATCTAATTCTCTCGGCTTCTTCTTGCAAGATCATTGCTCTAGGTATGGAAATGTATTCAAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987520
ATGGCTGCATTTTTGGTTGTGATTCTCACTCTCTTTTTAGGAATTGCTATTTTATTTAAACTTTTTGGCATCTCCATTTTCAAAGAAAATCCTGCAGGCTTACCTGATGGAAGCATGGGGCATTTCCCTTTCCTTGGTGAAACTCTTGCCTATCTCAAACCTCATAAATCTAATTCTCTCGGCTTCTTCTTGCAAGATCATTGCTCTAGGTATGGAAATGTATTCAAGTCCCATCTATTTGGGAGTCCAACAGTGGTGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767041.1
MAAFLVVILTLFLGIAILFKLFGISIFKENPAGLPDGSMGHFPFLGETLAYLKPHKSNSLGFFLQDHCSRYGNVFKSHLFGSPTVVSCDIELNQFILQNEETLFRSSYPKPVHDILGKLSMMLVSGDLHKKLRSVALSFINASKSSPAFLSYVDTFSLSFVHSWRSKTRLHFFKEAKKLTFYLMVKNLLSIEPDDPLAQNILEEFLTFMKGFVSLPVYIPGNAYSKAVKARRRISSTLKDALKKRIKIMENGSDVRGDFL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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