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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001892`

染色体: Chr06 坐标: 22635252-22645011 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001892`
名称	SmilChr06G001892
描述	uridine kinase-like protein 5
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	22635252 - 22645011 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987530`
GeneID	`130987530`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987530`
原始查询	`LOC130987530`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	uridine kinase-like protein 5
产物	uridine kinase-like protein 5
Arabidopsis	`AT3G27440` (UKL5) uridine kinase-like 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822365] identity=78.8; qcov=0.944; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os11g0265000` - identity=69.5; qcov=0.997; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0016301 (kinase activity)
KEGG	smil00240 (Pyrimidine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01232 (Nucleotide metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00485 (PRK); PF14681 (UPRTase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987530

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057767057.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057767059.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057767057.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767057.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767057.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:22635889`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,B123,D3
`Chr6:22635943`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:22637332`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr6:22637798`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr6:22637813`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:22644495`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B123,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767057.1

460 aa

230

460

PRK

UPRTase

PF00485 PRK 31-217 aa PF14681 UPRTase 246-448 aa

XP_057767059.1

376 aa

188

376

PRK

UPRTase

PF00485 PRK 31-217 aa PF14681 UPRTase 246-374 aa

XP_057767060.1

375 aa

188

375

PRK

UPRTase

PF00485 PRK 31-217 aa PF14681 UPRTase 246-374 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767057.1`	Pfam	`PF00485`	PRK	Domain	31	217	2.8e-50	171.6	Phosphoribulokinase / Uridine kinase family
`XP_057767057.1`	Pfam	`PF14681`	UPRTase	Domain	246	448	1.2e-76	257.5	Uracil phosphoribosyltransferase
`XP_057767059.1`	Pfam	`PF00485`	PRK	Domain	31	217	2.1e-50	172.0	Phosphoribulokinase / Uridine kinase family
`XP_057767059.1`	Pfam	`PF14681`	UPRTase	Domain	246	374	5.1e-42	144.4	Uracil phosphoribosyltransferase
`XP_057767060.1`	Pfam	`PF00485`	PRK	Domain	31	217	2.1e-50	172.0	Phosphoribulokinase / Uridine kinase family
`XP_057767060.1`	Pfam	`PF14681`	UPRTase	Domain	246	374	5.7e-42	144.2	Uracil phosphoribosyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911076.1
TGCTTGTTATTTTTCAGGAAAAAAATTCTTCATCAAAGTTGCGTAAATTTTGATTCCATTACCCTCCTTCCTCACTCTTCAGCTTCCACGACGAAGAAGGTGTTGAATCCTGATTAAGAATAGAGAGCAAATGATCTAAATTCAATGCCAAAATAAATTTTCTGGATATATAATTGCGAGATTTTCCTCCGATCCAATCTGACATCATGAAATCTGTAAATGCGGCCGCGCTAAAGAATACTAGCGATAATCGATCCAAT...

XM_057911077.1
TGCTTGTTATTTTTCAGGAAAAAAATTCTTCATCAAAGTTGCGTAAATTTTGATTCCATTACCCTCCTTCCTCACTCTTCAGCTTCCACGACGAAGAAGGTGTTGAATCCTGATTAAGAATAGAGAGCAAATGATCTAAATTCAATGCCAAAATAAATTTTCTGGATATATAATTGCGAGATTTTCCTCCGATCCAATCTGACATCATGAAATCTGTAAATGCGGCCGCGCTAAAGAATACTAGCGATAATCGATCCAAT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130987530
ATGAAATCTGTAAATGCGGCCGCGCTAAAGAATACTAGCGATAATCGATCCAATGGTGGGTCGGAGCAGAGTCAGCTCAAAGTTCCGTTCATAATCGGTGTTGCCGGTGGGACTGCGTCGGGTAAAACGACCGTTTGCGATATGATTATCGCGCAACTCCATGATCAGCGTGTTGTTCTCTTCAATCAAGATGCGTTTTATCGCTCCTTGAATGATGAGCAGTTGAAGAAAGTCGGTGAGTATAACTTCGATCATCCAGA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057767057.1
MKSVNAAALKNTSDNRSNGGSEQSQLKVPFIIGVAGGTASGKTTVCDMIIAQLHDQRVVLFNQDAFYRSLNDEQLKKVGEYNFDHPDAFDTELLLSCVEKLKHGRVATIPNYDFKTHQRVEPGRVVNPSDVIILEGILVLHDSRVRDLMNMKIFVDTDSDVRLGRRLRRDTVQRGRNVENVLDQYAKFVKPSFEEFILPSMKYADVIIPRGADNEVAIDLIVQHIRTKLGQHDLCKIYSNVFVIYSTFQIRGMHTLVRDA...

XP_057767059.1
MKSVNAAALKNTSDNRSNGGSEQSQLKVPFIIGVAGGTASGKTTVCDMIIAQLHDQRVVLFNQDAFYRSLNDEQLKKVGEYNFDHPDAFDTELLLSCVEKLKHGRVATIPNYDFKTHQRVEPGRVVNPSDVIILEGILVLHDSRVRDLMNMKIFVDTDSDVRLGRRLRRDTVQRGRNVENVLDQYAKFVKPSFEEFILPSMKYADVIIPRGADNEVAIDLIVQHIRTKLGQHDLCKIYSNVFVIYSTFQIRGMHTLVRDA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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