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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001903`

染色体: Chr06 坐标: 22834511-22837501 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001903`
名称	SmilChr06G001903
描述	CRM-domain containing factor CFM9, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	22834511 - 22837501 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987538`
GeneID	`130987538`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987538`
原始查询	`LOC130987538`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	CRM-domain containing factor CFM9, mitochondrial
产物	CRM-domain containing factor CFM9%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT3G27550` (AT3G27550) RNA-binding CRS1 / YhbY (CRM) domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822377] identity=81.1; qcov=0.552; evalue=5.78e-158; confidence=medium
Rice	`Os05g0145300` - identity=71.6; qcov=0.673; evalue=1.45e-160; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF01985 (CRS1_YhbY)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987538

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057767075.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057767075.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767075.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767075.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767075.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:22835200`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr6:22835318`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr6:22835447`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:22835503`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B90
`Chr6:22835905`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:22836059`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr6:22836106`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr6:22836112`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C51,C74
`Chr6:22836346`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,B132,C1
`Chr6:22837134`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B91,C27
`Chr6:22837232`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767075.1

565 aa

282

565

CRS1_YhbY

PF01985 CRS1_YhbY 146-229 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767075.1`	Pfam	`PF01985`	CRS1_YhbY	Domain	146	229	5.5e-14	53.0	CRS1 / YhbY (CRM) domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911092.1
AACAAACTGCTAAAACCCCTAAACCCAATCAAAAACCCTTCAAACTCCAATTCAATCGCGGCCGATTTTCAATTTCCGAAAGATTGCAGCAAAATGTTCTCTGTTTACACTAGAAATCTCCGAAATCAATCACTCAGAACCCTCTCTTCTCTCGTCCTCAATCAAAGGGTTGATGTCATCACGAGAAATAGTTTTGCTTCAAATTCGATGCGTGGAATCCCCAATGTGAGCCTAGCGAGCTGCGAATTGCCTTCGACGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987538
ATGTTCTCTGTTTACACTAGAAATCTCCGAAATCAATCACTCAGAACCCTCTCTTCTCTCGTCCTCAATCAAAGGGTTGATGTCATCACGAGAAATAGTTTTGCTTCAAATTCGATGCGTGGAATCCCCAATGTGAGCCTAGCGAGCTGCGAATTGCCTTCGACGGCGAACATGTGGAGCTGTTTTGATGGAGCACGGCGTTTCTCAGCGAAGAGTATGAGGAGTAAAGTGGAGAAGCGGATGCAGCGGGAGTCCGGCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767075.1
MFSVYTRNLRNQSLRTLSSLVLNQRVDVITRNSFASNSMRGIPNVSLASCELPSTANMWSCFDGARRFSAKSMRSKVEKRMQRESGKTLREIRRAKKLRKKLMTDEERLIYNLRRAKKKVALLLQKLKKYELPELPPPRHDPELFTAEQLQAYKKIGFRNKNYVPVGVRGVFGGVVQNMHLHWKFHETVQVCCDNFPKEKIKEMASMLTRLSGGIVVNVHNVKTIIMFRGRNYRQPKNLIPINTLTKRKALFKARFEQAL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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