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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002029`

染色体: Chr06 坐标: 26396161-26400374 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002029`
名称	SmilChr06G002029
描述	protein IN CHLOROPLAST ATPASE BIOGENESIS, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	26396161 - 26400374 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987550`
GeneID	`130987550`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987550`
原始查询	`LOC130987550`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein IN CHLOROPLAST ATPASE BIOGENESIS, chloroplastic-like
产物	protein IN CHLOROPLAST ATPASE BIOGENESIS%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT4G34090` (AT4G34090) cyclin delta-3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829555] identity=64.3; qcov=0.955; evalue=2.1e-156; confidence=high
Rice	`Os03g0109700` - identity=66; qcov=0.869; evalue=7.14e-155; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF28502 (PAB_middle); PF28503 (PAB_C); PF30404 (PAB_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987550

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057767092.1`
2	Mitochondrion intermembrane space	Mitochondrion intermembrane space	0.20000	`XP_057767092.1`
3	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.20000	`XP_057767092.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767092.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767092.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:26396753`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr6:26397303`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C2
`Chr6:26397303`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767092.1

352 aa

176

352

PAB_N

PAB_middle

PAB_C

PF30404 PAB_N 47-189 aa PF28502 PAB_middle 194-278 aa PF28503 PAB_C 282-350 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767092.1`	Pfam	`PF30404`	PAB_N	Domain	47	189	6.5e-67	224.5	PAB N-terminal
`XP_057767092.1`	Pfam	`PF28502`	PAB_middle	Repeat	194	278	1.4e-41	141.2	PAB middle domain
`XP_057767092.1`	Pfam	`PF28503`	PAB_C	Domain	282	350	7.4e-35	119.7	PAB C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911109.1
ATTCGTTGTGTGTGCTCGTGTTTTGTGAAAGAGATCCGTGAGGAAAGAATCTGCGTCTACAGTGTAGGATTTTTTATTAGTTGTTCCGGGTCGGGTCAGACATGGATTTCAGATTTGAACAGGGTACAACCCGGGTATACGGTGCAGCCGGTGTACACAAGATTTTGTGTGGGAGAAATTAGGGGCGTGAGATAATCCACATTTCCTCATTTTTCCATTCAAATATGAAATGAAATATAACATCCACAAAACCAGACTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987550
ATGAAATATAACATCCACAAAACCAGACTCACAGATATGAAGGCGGGCGGTGGAGTGGTGTTCGGAGTTCCACGCGCCTCCGCAGTTGTCTTTTCCCATCGCTGCCCCACCATTCGCTGCTACTCCTCATCTTTTCCGGACCATGCTTCGTTCATAAAAGATGTCGCCGCCGCAAAACCGCCGGAGCATTTGAATCAGCTTCTTAGAATACTTCAGGTCAGAGGCGAGCAAATTATTTCTCCGGGGGCAAAGCAAGGTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767092.1
MKYNIHKTRLTDMKAGGGVVFGVPRASAVVFSHRCPTIRCYSSSFPDHASFIKDVAAAKPPEHLNQLLRILQVRGEQIISPGAKQGLLPLAVPLSKNNSGSVTALLRWPTAPTGMEMPVVEVREYGVWLLAKNVEQYIKRILVEEDVKSPQERNEELFYASVDAGNNFYKKGDFAASQIPSLETYLLKKVGLFPDIIERKVKQHFDKGDHVSALVTGEFYTKKEHFPGFGRPFVFNAEVLLKVGRTLEAKDAARGALKSP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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