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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000012`

染色体: Chr06 坐标: 215642-219020 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000012`
名称	SmilChr06G000012
描述	leucine-rich repeat receptor-like protein kinase TDR
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	215642 - 219020 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987554`
GeneID	`130987554`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987554`
原始查询	`LOC130987554`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	leucine-rich repeat receptor-like protein kinase TDR
产物	leucine-rich repeat receptor-like protein kinase TDR
Arabidopsis	`AT5G51350` (MOL1) Leucine-rich repeat transmembrane protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835209] identity=51; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0111800` (OsCLVATA) - identity=36.8; qcov=1.04; evalue=0; confidence=medium
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF00560 (LRR_1); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF08263 (LRRNT_2); PF13855 (LRR_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987554

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057767112.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767112.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767112.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767112.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057767112.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:216060`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B41,C28
`Chr6:216394`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B55,C23
`Chr6:216435`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B127,B44,C15,D5
`Chr6:216458`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B63,B87,C18,D9
`Chr6:216488`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr6:216599`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr6:216795`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr6:216801`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr6:216807`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr6:216984`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B26,D11,D2
`Chr6:217028`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B127,B44,C15,D5
`Chr6:217137`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767112.1

938 aa

469

938

LRRNT_2

LRR_1

LRR_8

LRR_1

PK_Tyr_Ser-Thr

Pkinase

PF08263 LRRNT_2 35-76 aa PF00560 LRR_1 107-128 aa PF00560 LRR_1 130-152 aa PF00560 LRR_1 202-224 aa PF13855 LRR_8 297-355 aa PF00560 LRR_1 298-320 aa PF00560 LRR_1 563-582 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 730-888 aa PF00069 Pkinase 734-902 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767112.1`	Pfam	`PF08263`	LRRNT_2	Family	35	76	1.4e-06	29.2	Leucine rich repeat N-terminal domain
`XP_057767112.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	107	128	5.4e-41	130.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057767112.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	130	152	5.4e-41	130.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057767112.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	202	224	5.4e-41	130.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057767112.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	297	355	2.5e-34	117.5	Leucine rich repeat
`XP_057767112.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	298	320	5.4e-41	130.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057767112.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	563	582	5.4e-41	130.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057767112.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	730	888	4.5e-17	62.9	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057767112.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	734	902	6.8e-15	55.9	Protein kinase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911129.1
AATAATGGTCATTATTTGATAATGACAAATATGAATCTGATTAATTAACATCACCCTTTGGCCCCTCTTGCTCCCAAAAGCAATCCAATTATATTCTCATTTCAACTAATCTCACTGTGTCTGTCTGTGTGTGTGTGTTTCTCTCTCTCTCTCTTCTTCAATCTCTCTTTCTCCAGTCCCCATGCACACTCTCTCTCTCTCATGATATAAATAAGGTGACACACTACACAGTCTGTCTCTCTCTCACTTCATAACTGGGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987554
ATGCAAGTTCCAATGGAGATTCTCCAGCCCTTGTATCTCATTCTGCTAGCTCCTTTGATGTTGATGCAGCCACTTGTTGCAGATGATGATCCTCTCTCCTATGCCCTCTTGACCTTAAAATATGAAATTCTTGATCACTCCAACACCTTGAGTGACTGGTCTCTACCCTCTCAACCCCACCCCTCCCCCCAAATCCATGCATGCTCATGGACTGGAGTCCAATGCAACCACAACTCAACCAAAATCACTGCCATAGACCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767112.1
MQVPMEILQPLYLILLAPLMLMQPLVADDDPLSYALLTLKYEILDHSNTLSDWSLPSQPHPSPQIHACSWTGVQCNHNSTKITAIDLSMKNLGGSLSGKQFNLFVDLLDLNLSHNSFSDQLPPGIFHLKSLTSLDISRNNFSGVFPPGISNLTNLAVLDAFSNSFSGALPADVAYLDSLTVLNFAGSYFSGPIPSDYGSFKSIQFIHLAGNFLNGNIPPELGNLNTLSHMEIGYNLYEGGIPWQFGSMSELTYLDIADAK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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