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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000032`

染色体: Chr06 坐标: 302149-304541 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000032`
名称	SmilChr06G000032
描述	APO protein 4, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	302149 - 304541 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987574`
GeneID	`130987574`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987574`
原始查询	`LOC130987574`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	APO protein 4, mitochondrial-like
产物	APO protein 4%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT3G21740` (APO4) APO RNA-binding protein (DUF794) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821728] identity=48.5; qcov=1.05; evalue=1.57e-101; confidence=high
Rice	`Os04g0628000` (OsISC40) - identity=48.4; qcov=0.977; evalue=3.56e-96; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF05634 (APO_RNA-bind)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987574

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057767137.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057767137.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057767137.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767137.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767137.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:302334`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B106,B8,B84,C76
`Chr6:302347`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr6:302381`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,B140,B50
`Chr6:302505`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:302631`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B117,B127,B70,C61
`Chr6:302636`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:302706`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr6:302740`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B110,B128,B22,C44,C75
`Chr6:302759`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B41,C48,C73
`Chr6:302849`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,B117
`Chr6:302861`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr6:302918`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B127,B70,C61

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767137.1

311 aa

156

311

APO_RNA-bind

PF05634 APO_RNA-bind 39-172 aa PF05634 APO_RNA-bind 187-296 aa

XP_057767138.1

311 aa

156

311

APO_RNA-bind

PF05634 APO_RNA-bind 39-172 aa PF05634 APO_RNA-bind 187-296 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767137.1`	Pfam	`PF05634`	APO_RNA-bind	Family	39	172	5.7e-51	173.5	APO RNA-binding
`XP_057767137.1`	Pfam	`PF05634`	APO_RNA-bind	Family	187	296	5.7e-51	173.5	APO RNA-binding
`XP_057767138.1`	Pfam	`PF05634`	APO_RNA-bind	Family	39	172	5.7e-51	173.5	APO RNA-binding
`XP_057767138.1`	Pfam	`PF05634`	APO_RNA-bind	Family	187	296	5.7e-51	173.5	APO RNA-binding

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911155.1
AATTAGATATTTTAATACATTGTCTCTACTTTCAACTGTATAATTGATAATTGATTTCATTTTGTGGATCTTGTGCATATTTGTTTCGTAGAATGGGATGCAATATAAGTTATGTTGCTAAAGATATTAGACAAAAAGGCCGCGGGTTTTGATCATTGCCTTTGGAGTTTGGAGGCCGTATCGTATGTCCATTTTGTGCTTCTGGGATTGAGATGAGCTCCAGCAATCTTAAACTATGGCGAAATAAATCCCTAGTTCTC...

XM_057911154.1
TAGAATGGGATGCAATATAAGTTATGTTGCTAAAGATATTAGACAAAAAGGTATGAATCTCTCAATTTCTTTACTATTTCAGTCTTACCTAAGCCCGACCACATGCTTTATCGGGCCGGGCCATTTGATACCCAAACAGTCCGAAATTTTGTGATTTCTATCTGAAGTGATTCTTTCTCAAAATTGAATTTGAAGGCCGCGGGTTTTGATCATTGCCTTTGGAGTTTGGAGGCCGTATCGTATGTCCATTTTGTGCTTCT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130987574
ATGAGCTCCAGCAATCTTAAACTATGGCGAAATAAATCCCTAGTTCTCAAAGAAATGTTGAAAGGGCTTAGAAATTACAGCGCAAAATCGAATCTGGGCGTGGAACTGCAGAAGCTGAGGCCTTTGATAATGAAGCGAATTGAGCAAAGAGCCAAGGATCTTCCCGTCAATCCCGCGATTCCAGTGGCGCGTGAAGCCCTCCGTGCCCGAAACGCTCTCTACGACGGCGTATCGGCCCTCATCACCCACATTCCGGTCTG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057767137.1
MSSSNLKLWRNKSLVLKEMLKGLRNYSAKSNLGVELQKLRPLIMKRIEQRAKDLPVNPAIPVAREALRARNALYDGVSALITHIPVWACKYCPEVYIGESGHLIRTCHGYRHHSKNKVHEWVKASINDIIIPVESLHLQKTFRDVTKHREIFDHQRVPAVVELCLQAGVDANDQSVITPPFPDDDLQLIARRTVNAWETLRSQVHKLLMEHPARVCKHCEEVHVGPWGQKARSRGVVKHESCHLWRRAGVEDLVPSNVVW...

XP_057767138.1
MSSSNLKLWRNKSLVLKEMLKGLRNYSAKSNLGVELQKLRPLIMKRIEQRAKDLPVNPAIPVAREALRARNALYDGVSALITHIPVWACKYCPEVYIGESGHLIRTCHGYRHHSKNKVHEWVKASINDIIIPVESLHLQKTFRDVTKHREIFDHQRVPAVVELCLQAGVDANDQSVITPPFPDDDLQLIARRTVNAWETLRSQVHKLLMEHPARVCKHCEEVHVGPWGQKARSRGVVKHESCHLWRRAGVEDLVPSNVVW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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