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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002847`

染色体: Chr01 坐标: 47035908-47038462 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002847`
名称	SmilChr01G002847
描述	protein OXIDATIVE STRESS 3 LIKE 2-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	47035908 - 47038462 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987579`
GeneID	`130987579`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987579`
原始查询	`LOC130987579`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein OXIDATIVE STRESS 3 LIKE 2-like
产物	protein OXIDATIVE STRESS 3 LIKE 2-like
Arabidopsis	`AT3G43850` (AT3G43850) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823498] identity=50.4; qcov=0.433; evalue=3.47e-26; confidence=low
Rice	`Os02g0778700` - identity=44.4; qcov=0.533; evalue=5.43e-19; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF30470 (OXS3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987579

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057767146.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057767146.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767146.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767146.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057767146.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:47036166`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:47036341`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,B64
`Chr1:47036463`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34
`Chr1:47036467`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr1:47036520`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr1:47037591`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B70
`Chr1:47037624`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B18

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767146.1

289 aa

144

289

OXS3

PF30470 OXS3 54-103 aa PF30470 OXS3 124-246 aa

XP_057767153.1

270 aa

135

270

OXS3

PF30470 OXS3 54-227 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767146.1`	Pfam	`PF30470`	OXS3	Family	54	103	6.7e-46	157.2	Oxidative stress 3
`XP_057767146.1`	Pfam	`PF30470`	OXS3	Family	124	246	6.7e-46	157.2	Oxidative stress 3
`XP_057767153.1`	Pfam	`PF30470`	OXS3	Family	54	227	8.4e-54	183.0	Oxidative stress 3

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911170.1
TTATTTATCCAATTTGGAAATTGTGCTGCTTTTGTCTTTGGATAAAGATAAGCCCTTTCACGATCAATATCTTCTCTCTCGTTTAGTTTACTCTTCCCTCTCTCTCTTACAGTTTCTCTCTCCACCAATACATACGCGGTACATGTATCTATAGAAAAACCTTCTCGACAACAGTGTAGGGGAGATGTCGATAGCCTTGCAGAGGAACAACTCAGGCGGCGGCCACCCGATCGAAGGGCCAGGATTCGTTCACTGCGAGA...

XM_057911163.1
TTGTCTTTGGATAAAGATAAGCCCTTTCACGATCAATATCTTCTCTCTCGTTTAGTTTACTCTTCCCTCTCTCTCTTACAGTTTCTCTCTCCACCAATACATACGCGGTACATGTATCTATAGAAAAACCTTCTCGACAACAGTGTAGGGGAGATGTCGATAGCCTTGCAGAGGAACAACTCAGGCGGCGGCCACCCGATCGAAGGGCCAGGATTCGTTCACTGCGAGATGGCTTATGTTTCGTCGCCTTATGACCCGCC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130987579
ATGTCGATAGCCTTGCAGAGGAACAACTCAGGCGGCGGCCACCCGATCGAAGGGCCAGGATTCGTTCACTGCGAGATGGCTTATGTTTCGTCGCCTTATGACCCGCCGGAGCTATCAGCGGCCGATCGGCTGTCTCCGGAGGCGGAGGATGCAAGCGGTTCGTTGTCATCTTCATCCAGTTCTTCAATTGGAAAGAACAGTGACGAGCATCCCGGCGGCGGCAGCGGCAGTGATGAAGAGGAAGTGCAGAGTCAATATAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057767146.1
MSIALQRNNSGGGHPIEGPGFVHCEMAYVSSPYDPPELSAADRLSPEAEDASGSLSSSSSSSIGKNSDEHPGGGSGSDEEEVQSQYKGGPLDNLDSLEEVLPVNVVSRENCQLLCSASTGSALKSISKFYSGKSKSFTSLSDAASIPSIKEITKPENAYTRKRKNLLVFNNLWDKNQNSIIKNRIGGISKRPTNSRSMLSLAANMNCSESNSGETSNSNSSPPGCSLPPLPPHVRRSMKSELSSSPPVDKFPSWRSFSLS...

XP_057767153.1
MSIALQRNNSGGGHPIEGPGFVHCEMAYVSSPYDPPELSAADRLSPEAEDASGSLSSSSSSSIGKNSDEHPGGGSGSDEEEVQSQYKGGPLDNLDSLEEVLPVKKSISKFYSGKSKSFTSLSDAASIPSIKEITKPENAYTRKRKNLLVFNNLWDKNQNSIIKNRIGGISKRPTNSRSMLSLAANMNCSESNSGETSNSNSSPPGCSLPPLPPHVRRSMKSELSSSPPVDKFPSWRSFSLSDLQGAAVAEAATPSAGGLW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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