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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000043`

染色体: Chr06 坐标: 361989-362903 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000043`
名称	SmilChr06G000043
描述	uncharacterized SmilChr06G000043
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	361989 - 362903 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987586`
GeneID	`130987586`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987586`
原始查询	`LOC130987586`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Cytochrome c oxidase, subunit Vib family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835912]; symbol=AT5G58005; hit=AT5G58005; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Cytochrome c oxidase, subunit Vib family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835912]; symbol=AT5G58005; hit=AT5G58005; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G58005` (AT5G58005) Cytochrome c oxidase, subunit Vib family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835912] identity=61.4; qcov=0.934; evalue=2.7e-47; confidence=medium
Rice	`Os08g0441400` - identity=64.7; qcov=0.811; evalue=6.67e-44; confidence=medium
GO	GO:0005739 (mitochondrion); GO:0045277 (respiratory chain complex IV)
KEGG	-
Pfam	PF02297 (COX6B)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987586

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057767155.1`
2	Mitochondrion intermembrane space	Mitochondrion intermembrane space	0.80000	`XP_057767155.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767155.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767155.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767155.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:362083`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:362361`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767155.1

122 aa

122

COX6B

PF02297 COX6B 21-90 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767155.1`	Pfam	`PF02297`	COX6B	Domain	21	90	3.6e-13	50.1	Cytochrome oxidase c subunit VIb

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911172.1
AAGAAAACAGAGAATTGTATATATAGACGAGAAAGCAAATAGTTTGGTTTCCGAAGAAAAAGCATACAAAAATGTCGCTGGAAGATTACACGTCGCAGGTGCCCGATAAAGTTCGCACAGACGTACTATCGCAAGCGCGACTAGCTTGCTACAAGGCGCGGGATGCGTTTCACACTTGTCTGGAGAGAGAAGCGAAGAAAAAGCCGACGGAGATCGCGTCGGTGGGGCTGCTTTTCCCGTCCGATTGCCAAAAAAATAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987586
ATGTCGCTGGAAGATTACACGTCGCAGGTGCCCGATAAAGTTCGCACAGACGTACTATCGCAAGCGCGACTAGCTTGCTACAAGGCGCGGGATGCGTTTCACACTTGTCTGGAGAGAGAAGCGAAGAAAAAGCCGACGGAGATCGCGTCGGTGGGGCTGCTTTTCCCGTCCGATTGCCAAAAAAATAGGGAGGAATACGTTAAGATGTGCCGACCTGCTTGGGTGAAGCATTTCGATCGTGAGTATTGCGTGAAGAAGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767155.1
MSLEDYTSQVPDKVRTDVLSQARLACYKARDAFHTCLEREAKKKPTEIASVGLLFPSDCQKNREEYVKMCRPAWVKHFDREYCVKKRCRRLLDDQEMMRRGPMSLPQSSTFKSSSCSCSSST

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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