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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000044`

染色体: Chr06 坐标: 363357-364842 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000044`
名称	SmilChr06G000044
描述	uncharacterized SmilChr06G000044
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	363357 - 364842 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987587`
GeneID	`130987587`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987587`
原始查询	`LOC130987587`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Cytochrome c oxidase, subunit Vib family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835912]; symbol=AT5G58005; hit=AT5G58005; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Cytochrome c oxidase, subunit Vib family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835912]; symbol=AT5G58005; hit=AT5G58005; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G58005` (AT5G58005) Cytochrome c oxidase, subunit Vib family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835912] identity=65; qcov=0.99; evalue=4.08e-45; confidence=medium
Rice	`Os08g0441400` - identity=69; qcov=0.861; evalue=2.04e-42; confidence=medium
GO	GO:0005739 (mitochondrion); GO:0045277 (respiratory chain complex IV)
KEGG	-
Pfam	PF02297 (COX6B)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987587

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057767156.1`
2	Mitochondrion intermembrane space	Mitochondrion intermembrane space	1.00000	`XP_057767156.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767156.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767156.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767156.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:363505`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr6:363924`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr6:364339`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	53	A11,B1,B10,B100,B109,B110,B119,B132,B136,B15,B17,B21,B24,B25,B28,B30,B34,B35,B40,B42,B43,B45,B46,B56,B64,B72,B73,B74,B86,B88,B9,B96,C15,C19,C22,C27,C29,C31,C36,C56,C57,C59,C60,C61,C64,C65,C66,C7,C76,C85,D1,D3,D8
`Chr6:364345`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	27	A16,A22,B107,B111,B115,B133,B135,B21,B23,B31,B7,B70,B79,B8,B86,B90,B91,B92,C26,C41,C5,C53,C56,C76,C80,C84,D9
`Chr6:364363`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	15	A16,B10,B117,B129,B137,B138,B139,B14,B26,B50,B76,B91,C10,C5,C74
`Chr6:364366`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	14	A16,B10,B129,B137,B138,B139,B14,B26,B50,B76,B91,C10,C5,C74
`Chr6:364373`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B117
`Chr6:364373`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B117

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767156.1

121 aa

121

COX6B

PF02297 COX6B 22-91 aa

XP_057767157.1

101 aa

101

COX6B

PF02297 COX6B 22-91 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767156.1`	Pfam	`PF02297`	COX6B	Domain	22	91	9.1e-14	52.1	Cytochrome oxidase c subunit VIb
`XP_057767157.1`	Pfam	`PF02297`	COX6B	Domain	22	91	6.5e-14	52.5	Cytochrome oxidase c subunit VIb

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XR_009089801.1
ATTTTTCTTCCCTTCTTCATCAGTTATTCGAAGCAAAAATAAGAAAAATAGTAAAAATTAGGGAAAAAATAGTGCGAAGCATTTCGATTCTGGAATGGCGTTGGAAACGCGCTCGTCTCAAGCCCTCGATGCAGTTCACACAGATGTTCTATCACAAGCAAGATTAGCTTGCTACAAGGCACGAGATGCGTTCTATACGTGTCTAGAGAGAGAAGCGAACAAGAAGCCCACAGAAATTGCGTCGGTGGGGCTGCTCTACC...

XR_009089802.1
ATTTTTCTTCCCTTCTTCATCAGTTATTCGAAGCAAAAATAAGAAAAATAGTAAAAATTAGGGAAAAAATAGTGCGAAGCATTTCGATTCTGGAATGGCGTTGGAAACGCGCTCGTCTCAAGCCCTCGATGCAGTTCACACAGATGTTCTATCACAAGCAAGATTAGCTTGCTACAAGGCACGAGATGCGTTCTATACGTGTCTAGAGAGAGAAGCGAACAAGAAGCCCACAGAAATTGCGTCGGTGGGGCTGCTCTACC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130987587
ATGGCGTTGGAAACGCGCTCGTCTCAAGCCCTCGATGCAGTTCACACAGATGTTCTATCACAAGCAAGATTAGCTTGCTACAAGGCACGAGATGCGTTCTATACGTGTCTAGAGAGAGAAGCGAACAAGAAGCCCACAGAAATTGCGTCGGTGGGGCTGCTCTACCCTGTCGAATGCAAGCAAAGTAGGGAGGCGTATGTGAAGCAGTGCAGGCCTACTTGGGTGAAGCATTTTGATCGGCAGTATTGTCAGAAGAAGAG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057767156.1
MALETRSSQALDAVHTDVLSQARLACYKARDAFYTCLEREANKKPTEIASVGLLYPVECKQSREAYVKQCRPTWVKHFDRQYCQKKRVNRLLDDNESRRGYLSFVTDWLAYYILCLMERRR

XP_057767157.1
MALETRSSQALDAVHTDVLSQARLACYKARDAFYTCLEREANKKPTEIASVGLLYPVECKQSREAYVKQCRPTWVKHFDRQYCQKKRVNRLLDDNESRRGG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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