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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000048`

染色体: Chr06 坐标: 395682-399932 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000048`
名称	SmilChr06G000048
描述	reticulon-like protein B21
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	395682 - 399932 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987591`
GeneID	`130987591`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987591`
原始查询	`LOC130987591`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	reticulon-like protein B21
产物	reticulon-like protein B21
Arabidopsis	`AT5G58000` (AT5G58000) Reticulon family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835911] identity=37.2; qcov=1.05; evalue=3.11e-106; confidence=medium
Rice	`Os08g0280600` - identity=56.7; qcov=0.385; evalue=9.65e-82; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02453 (Reticulon)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987591

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus membrane	核膜	0.60000	`XP_057767160.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057767160.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057767160.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767160.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767160.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:395912`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	16	A19,A8,B111,B129,B130,B19,B3,B34,B75,B79,C31,C49,C52,C75,C83,D3
`Chr6:397022`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,B80
`Chr6:397697`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B51
`Chr6:398072`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,C24
`Chr6:398363`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B139,B37,B74,B99,C83
`Chr6:398557`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B5,B6,B62,C67
`Chr6:398557`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B5,B6,B62,C67
`Chr6:398992`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B106
`Chr6:399381`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:399419`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr6:399493`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B102,B54,C42
`Chr6:399514`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767160.1

545 aa

272

545

Reticulon

PF02453 Reticulon 299-450 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767160.1`	Pfam	`PF02453`	Reticulon	Family	299	450	3.5e-25	89.5	Reticulon

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911177.1
CTCGACCAAAAAAGAAACAAATATGATATTTAAAGAAATCTCGAAATTATTTGAATTCCCCCTTCAATCCGAATGAATGAATAATGGTACTGCATTTACATCGATTAAATTATGAGATCACGACAACAACAAAATCCTTTGAAATCATGTTGTAGTGTTGTCGTCAATAAATTCATCAAAATTATGTACCTCTGTAAAAGTCACCATTTATGGGCAAAAAGAAGAAAACAGAGCTACGCAGACGGAATAATCTCTCTCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987591
ATGAGTAGTAAAGAATCAGTGGATTTAGGTGGCGGCAGCAGAAGAAGAGGCAGCGCCCCCAAAGCAGGCTCTGTTTGGGAGAGCAGGATGAAGCTCGATCAAGTCAAAGGCGGCATCAAAGTTTTCAAGGCCGCTGATGAAAATTCAGATCAAAACACTCAAAATAGCGCTGCTGCTGCTTCTGCTGTTGCTGTTGCAGTTGCGGTTGCAGAGACGAGCGCCGAGATTGATATCTGCAGAAATGAGAAGCCCAAACAGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767160.1
MSSKESVDLGGGSRRRGSAPKAGSVWESRMKLDQVKGGIKVFKAADENSDQNTQNSAAAASAVAVAVAVAETSAEIDICRNEKPKQSPNGLSGKRKTWKSEGSDGSPVKIAALRSELSRNLDEQINELSDGVKKTPVSIRKSSLRKLNSSSVEALARASVVDEKKIEKSDGDDERERKSRSDENCEEVGVCEEIKAAVTSSVPQINGGDESDFDGDEEIEVEKSIDVEEIAVGDHTQKRIVIEEKKSIQRNQKPVHISSI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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