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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000051`

染色体: Chr06 坐标: 412104-417782 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000051`
名称	SmilChr06G000051
描述	ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 23-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	412104 - 417782 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987595`
GeneID	`130987595`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987595`
原始查询	`LOC130987595`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 23-like
产物	ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 23-like
Arabidopsis	`AT5G57990` (UBP23) ubiquitin-specific protease 23 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835910] identity=61.2; qcov=0.517; evalue=0; confidence=medium
Rice	`Os06g0184300` (BIP110) - identity=42.1; qcov=1.04; evalue=0; confidence=medium
GO	GO:0004197 (cysteine-type endopeptidase activity); GO:0004843 (cysteine-type deubiquitinase activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0005829 (cytosol); GO:0016579 (protein deubiquitination)
KEGG	-
Pfam	PF00443 (UCH); PF13423 (UCH_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987595

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057767166.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767166.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767166.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057767166.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057767166.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:412485`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B27,C10,C54
`Chr6:412493`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B41,B55,C12,C23,C44
`Chr6:412495`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:412547`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:412559`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11
`Chr6:412570`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:412583`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:412940`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B58,C30
`Chr6:413020`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr6:413056`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A16
`Chr6:413147`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr6:413188`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767166.1

922 aa

461

922

UCH_1

UCH

PF13423 UCH_1 95-378 aa PF00443 UCH 95-396 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767166.1`	Pfam	`PF13423`	UCH_1	Domain	95	378	4.5e-20	73.2	Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase
`XP_057767166.1`	Pfam	`PF00443`	UCH	Family	95	396	1.9e-63	215.2	Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911183.1
AAAAAAGAAGTTAGTTAGAGACAAGAAGAAAAAGAAGTTGGTATATATGTAATGTAAACCCTAGGCATTCATAACCAGCACTCGTCGCCGACATTATCGAAAGCTTAATCTCTCGGATTCATTCACGCTTTCATCTTTTCTTTGTGCATGAGATTGTGCTGCAAAATCTATATCGAAATCCACAAACTTCTTTTTAGAGAATTTATGTGTTTTTGAGGTGCAAGAGAGGTGTTTGGAGCTCGATTTATATATGGCGGAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987595
ATGGCGGAAACGGCGACGACGACGATCAGTTCGAATGGGGTGGGCAGGGCCGAGCCGGAGTCCGATACGGTGGCGCTGTTCCATAGGAGGATTGAGTTCCACCCAGCTCGGAAGCATTCCAATGGCTTTGTAAACGAGAGCAGCAATGGGTTTAAGCTGGTGACGCTGAACCCGGTCAAGGCTTCCTCTGTTTTCGGCACTAAAAACGAAAAATCATCGGAGCATTCTGATGTCAGGTTGGATCCTGAGCTCAGCTTCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767166.1
MAETATTTISSNGVGRAEPESDTVALFHRRIEFHPARKHSNGFVNESSNGFKLVTLNPVKASSVFGTKNEKSSEHSDVRLDPELSFEITFRRIGAGLRNLGNTCFLNSVLQCLTYTAPLAAYLQSGKHQNSCRTAGFCALCAIQKHVSRALQSSGRILEPKDLVSNLRCISRSFRNARQEDAHEYMVNLLESMHKCCLPSGVPSESPSAYEKSLVHKIFGGRLRSQVKCMQCSYCSNKFDPFLDLSLEIQKADSLYKALA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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