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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000071`

染色体: Chr06 坐标: 548778-552231 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000071`
名称	SmilChr06G000071
描述	serine carboxypeptidase II-2
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	548778 - 552231 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987615`
GeneID	`130987615`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987615`
原始查询	`LOC130987615`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine carboxypeptidase II-2
产物	serine carboxypeptidase II-2
Arabidopsis	`AT4G30810` (scpl29) serine carboxypeptidase-like 29 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829204] identity=63.7; qcov=0.957; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0186400` (OsSCP32) - identity=66.5; qcov=0.93; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004185 (serine-type carboxypeptidase activity); GO:0005773 (vacuole); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF00450 (Peptidase_S10)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987615

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057767194.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767194.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767194.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767194.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057767194.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:549049`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr6:549068`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr6:549069`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	17	A16,A18,B100,B103,B18,B30,B63,B82,B85,B86,B97,C12,C13,C21,C70,C79,C83
`Chr6:550123`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr6:550138`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B86,C29,C51
`Chr6:550343`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr6:550870`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B98
`Chr6:551013`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,B69
`Chr6:551039`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B98
`Chr6:551051`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B137,C55
`Chr6:551099`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B106,B122,C21
`Chr6:551240`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767194.1

469 aa

234

469

Peptidase_S10

PF00450 Peptidase_S10 43-457 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767194.1`	Pfam	`PF00450`	Peptidase_S10	Domain	43	457	2.4e-151	505.6	Serine carboxypeptidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911211.1
AAGGAGAAGAAAAAGACTCACCCCCGGCAATAATGGACGCATTCTTTCAATAATAATAATAAAAAATATCACTATAATAAAAACACACCCACTTCATCTTTATTGGGACTGTAAAAAAACACTTTCTTCCCCAATCCAATCGCAGGATTACTCGAAAAGATGCCATTTTTGAGATGGGTTTTCAACGTTTTCGTCGTGATATCAGTTGCAGAGTTCCTTCCGATCAGCTGCAGCAGCAGCAGTTTCTCGTCTAATCAGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987615
ATGCCATTTTTGAGATGGGTTTTCAACGTTTTCGTCGTGATATCAGTTGCAGAGTTCCTTCCGATCAGCTGCAGCAGCAGCAGTTTCTCGTCTAATCAGCAGCAGTTGGACAGAGTGTTGAAGCTTCCTGGCCAGAATTTCAACGTGAGCTTCGCGCACTACTCTGGTTACATTACTGTCAACGAAGAATCTGGGAGGGAGCTTTTCTATTGGTTCTTTGAGGCTGAGGAGGACCCTTCGTCCAAGCCTCTCGTTCTCTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767194.1
MPFLRWVFNVFVVISVAEFLPISCSSSSFSSNQQQLDRVLKLPGQNFNVSFAHYSGYITVNEESGRELFYWFFEAEEDPSSKPLVLWLNGGPGCSSIAYGLAEEIGPLHIEKDGKTLYLNPYSWNKVANILFVDSPVGVGFSYSNTSSDLLSNGDNRTAADNLKFIEKWLERFPQYKGSDFYLTGESYAGHYVPQLTRAIVQHNEKNGEETINLKGFMVGNALTDDFHDHFGVFQFMWSVGMISDQTYKQLNVKCDFQSF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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