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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000077`

染色体: Chr06 坐标: 581654-583204 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000077`
名称	SmilChr06G000077
描述	F-box/kelch-repeat protein At3g23880-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	581654 - 583204 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987621`
GeneID	`130987621`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987621`
原始查询	`LOC130987621`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/kelch-repeat protein At3g23880-like
产物	F-box/kelch-repeat protein At3g23880-like
Arabidopsis	`AT3G23880` (AT3G23880) F-box and associated interaction domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821971] identity=26.9; qcov=0.913; evalue=6.58e-18; confidence=low
Rice	`Os09g0449600` (OsFbox490) - identity=24.8; qcov=0.764; evalue=1.22e-10; confidence=weak
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF07734 (FBA_1); PF08268 (FBA_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987621

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057767202.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057767202.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057767202.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767202.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767202.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:581663`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	18	A10,B10,B114,B28,B60,B63,B64,B74,B8,B85,B89,C30,C47,C52,C55,C57,C65,C81
`Chr6:581667`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	20	A10,B10,B104,B114,B28,B60,B63,B64,B74,B8,B85,B89,C25,C30,C47,C52,C55,C57,C65,C81
`Chr6:581687`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,C86
`Chr6:581725`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,C86
`Chr6:581739`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr6:581740`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr6:581754`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:581787`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr6:581791`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr6:581801`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B4,B54,B57,C26
`Chr6:581803`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr6:581804`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767202.1

322 aa

161

322

F-box

FBA_3

FBA_1

PF00646 F-box 20-49 aa PF08268 FBA_3 106-295 aa PF07734 FBA_1 111-288 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767202.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	20	49	0.00017	22.1	F-box domain
`XP_057767202.1`	Pfam	`PF08268`	FBA_3	Repeat	106	295	2e-09	37.7	F-box associated beta propeller domain
`XP_057767202.1`	Pfam	`PF07734`	FBA_1	Repeat	111	288	5e-18	65.9	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911219.1
AGATGAATAATTTGAAGAAGCAAAGGGTGCTGTCAGGCGAAGAAGTTGTTGAAGATTTGATCCCAGAGATACTGTGTCGTGTGGCGGAGGTGAAATCCGTGTTGAGATTCCGATGCGTCTCGAAATCATGGCGGTCTCTGATCGACAGCGGATTTTTCATCGACAAACACGCGAAGAAAGCAAGAAACACGGCGGCGGCGCACGGCCACGAGAGAGTCGTCTTCAACGCCCGAGGAGAGTCCAACCAATGCTGTGTGTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987621
ATGAATAATTTGAAGAAGCAAAGGGTGCTGTCAGGCGAAGAAGTTGTTGAAGATTTGATCCCAGAGATACTGTGTCGTGTGGCGGAGGTGAAATCCGTGTTGAGATTCCGATGCGTCTCGAAATCATGGCGGTCTCTGATCGACAGCGGATTTTTCATCGACAAACACGCGAAGAAAGCAAGAAACACGGCGGCGGCGCACGGCCACGAGAGAGTCGTCTTCAACGCCCGAGGAGAGTCCAACCAATGCTGTGTGTGGTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767202.1
MNNLKKQRVLSGEEVVEDLIPEILCRVAEVKSVLRFRCVSKSWRSLIDSGFFIDKHAKKARNTAAAHGHERVVFNARGESNQCCVWWCYLDESTPALMDMDPTNAHLAAAHVIGHCNGLLCILDAGEGRIFLWNPATRISAELPRLEHKRIAKCGFGWDEETCAYKVFVGWRNDDADDEGHMIMGARVYSSNTNCWEQVETHGSDIYIHWIGASSSWGKIHWLVPTGLGFGVRLESFDLKTESFATTELPCVGGLGVCLT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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