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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000091`

染色体: Chr06 坐标: 654629-655603 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000091`
名称	SmilChr06G000091
描述	RING-H2 finger protein ATL56-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	654629 - 655603 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987636`
GeneID	`130987636`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987636`
原始查询	`LOC130987636`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RING-H2 finger protein ATL56-like
产物	RING-H2 finger protein ATL56-like
Arabidopsis	`AT2G18670` (AT2G18670) RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816382] identity=33.6; qcov=0.849; evalue=5.83e-18; confidence=low
Rice	`Os06g0536100` - identity=27.7; qcov=0.797; evalue=1.63e-14; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00097 (zf-C3HC4); PF13639 (zf-RING_2); PF13923 (zf-C3HC4_2); PF17123 (zf-RING_11)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987636

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057767217.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057767217.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057767217.1`
4	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057767217.1`
5	Endosome	内体	0.20000	`XP_057767217.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:654902`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B76,B93,C53
`Chr6:655016`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B130,B51,B94
`Chr6:655049`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr6:655088`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B45,C24,C31,C79
`Chr6:655105`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B113,B8,B84
`Chr6:655107`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr6:655118`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B106
`Chr6:655120`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,A16,B122,C41,C83
`Chr6:655121`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B106,B93
`Chr6:655124`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,B93
`Chr6:655132`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C47,C81,C84
`Chr6:655147`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B88,C47,C81,C84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767217.1

172 aa

172

zf-RING_11

zf-RING_2

zf-C3HC4

zf-C3HC4_2

PF17123 zf-RING_11 102-131 aa PF13639 zf-RING_2 102-145 aa PF00097 zf-C3HC4 103-144 aa PF13923 zf-C3HC4_2 103-144 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767217.1`	Pfam	`PF17123`	zf-RING_11	Domain	102	131	1.2e-09	38.3	RING-like zinc finger
`XP_057767217.1`	Pfam	`PF13639`	zf-RING_2	Domain	102	145	9.7e-14	52.1	Ring finger domain
`XP_057767217.1`	Pfam	`PF00097`	zf-C3HC4	Domain	103	144	1.5e-06	28.6	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)
`XP_057767217.1`	Pfam	`PF13923`	zf-C3HC4_2	Domain	103	144	4e-08	33.6	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911234.1
CAAAATTGATATAAATAAATTGGTGGCGCAAATTCACTCTCAATAAACCTTACCTAAATTTCTATTTTATTTCTATTTTATTTTATTTTTGTTTGCTGTTTAAGGTTGCAACCACGGCCCCATCTCTTCTCTCTCTCCAAAATCCAAATCCAAATATCTTTTCCCCAAAAAAATGTGAAAAAAAAGAAGAAAAAAAATTACATCTTTTCAATCTCTTTCATCCCTTCATCACAGAATCACCCAACTCGATCCAATTCCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987636
ATGCCCGATTCTCCCCAAGAAAACCAGCAGCGCCGCGCGCCGCGGCTGATGAGCCGGAGCCAGAGGAAGCTCCTCCTCTTCTTCCTGAAATGCGTAATCATGGCAATCGTGATGTCCCTCTTCCTCTTCTTCCTAGGGTTCGCGGCCATCGTGCTCCTCCACTTCCTCTTCATGTCCAACACCTTCAGCCGCCGCTGCACCCGCCTCCTCCACCCCGCCCCCGCCGAGGCGGATCCCGAGCCGGACTTCGAGGCGCTTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767217.1
MPDSPQENQQRRAPRLMSRSQRKLLLFFLKCVIMAIVMSLFLFFLGFAAIVLLHFLFMSNTFSRRCTRLLHPAPAEADPEPDFEALLPGVAYCLADSPQASDCAICLDSFREGDNCRKIPICKHLFHSNCVDRWIGRKPNCPVCRTRVDLDPPGGDRWKNLWAVNFEEGASY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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