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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002853`

染色体: Chr01 坐标: 47120611-47123446 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002853`
名称	SmilChr01G002853
描述	replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit B-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	47120611 - 47123446 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987641`
GeneID	`130987641`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987641`
原始查询	`LOC130987641`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit B-like
产物	replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit B-like
Arabidopsis	`AT2G05642` (AT2G05642) Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819430] identity=22.2; qcov=0.899; evalue=1.62e-22; confidence=weak
Rice	`Os07g0190600` - identity=22.9; qcov=0.65; evalue=3.51e-14; confidence=weak
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006260 (DNA replication); GO:0006281 (DNA repair); GO:0006310 (DNA recombination)
KEGG	-
Pfam	PF02721 (DUF223); PF08646 (Rep_fac-A_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987641

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057767225.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767225.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767225.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057767225.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057767225.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:47120809`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B126
`Chr1:47120872`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B126,C87
`Chr1:47120879`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B2,B33,B66
`Chr1:47120880`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,C60,C76
`Chr1:47120904`	`T`	`TCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	17	A11,B101,B136,B43,B58,B65,B78,B97,C16,C29,C31,C32,C48,C57,C61,C68,D2
`Chr1:47120919`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	32	A20,A23,B100,B103,B109,B112,B120,B123,B128,B24,B28,B31,B4,B46,B56,B58,B63,B69,B84,B96,C1,C32,C37,C4,C43,C50,C57,C68,C72,C77,C81,C83
`Chr1:47120950`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,C30
`Chr1:47121079`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr1:47121117`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	29	A16,A20,A25,A5,B112,B119,B121,B122,B125,B24,B3,B31,B35,B47,B54,B63,B78,B85,B90,B92,B98,C14,C33,C61,C74,C78,C83,D1,D3
`Chr1:47121126`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	29	A16,A20,A25,A5,B112,B119,B121,B122,B125,B24,B3,B31,B35,B47,B54,B63,B78,B85,B90,B92,B98,C14,C33,C61,C74,C78,C83,D1,D3
`Chr1:47121140`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B98,C60
`Chr1:47121140`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B98,C60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767225.1

545 aa

272

545

DUF223

Rep_fac-A_C

PF02721 DUF223 32-150 aa PF08646 Rep_fac-A_C 328-432 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767225.1`	Pfam	`PF02721`	DUF223	Domain	32	150	2.6e-13	50.9	Domain of unknown function DUF223
`XP_057767225.1`	Pfam	`PF08646`	Rep_fac-A_C	Domain	328	432	3e-11	44.0	Replication factor-A C terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911242.1
TAGTCTTCAAATTACTGTTCAGCGACTCATGGTTTCTAGCGTAGAGGGCCCACAAATGGTACGAAGAGGAATGATGAGATTTGAAGCATTACATCAAAGAGATTGTGGATGAGCAAACTTAGATTTGAGGCGTTCTATGAAAGAGGTTTCACGGATTGCATTGGAAGCATAATCCCGAGAATTCTTCTATAAATACATGGCCATTTCATCGATTTTATACTCACCCAAATCAAGCGATTGTGATCTTCAGCAATTGTTAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987641
ATGGCCATTTCATCGATTTTATACTCACCCAAATCAAGCGATTGTGATCTTCAGCAATTGTTAAAGATGGCGCCTTTGCTCTGTTCAGTAAATGATCTGCATCCTTCTTTGATAACATCAGCAATCAAAATCAGGGTGGTACGTGCATACGGTCTTCTTTTTAATGGTGATTCACAGCATATGATGAGCTTTGAATGCATTCTTCAAGACGAAGAGGGTGTGAAGATTCATGCTTCGTTCGCACGTAACTTGGCTGGTAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767225.1
MAISSILYSPKSSDCDLQQLLKMAPLLCSVNDLHPSLITSAIKIRVVRAYGLLFNGDSQHMMSFECILQDEEGVKIHASFARNLAGSAASKIKEGCCYDFYKFYMRPNHMRFKTTDHEFRIVMTQKSQIFEITADDFPNEMFSFRTFAEIAGIKSVGDAALFDVIGVIVESGGVINQPNRKMLEIKIEDENHDSVVCTLWEEYVDEFLSQIDPNVKQIPIVLIQYCRPISYEGEIRISTSYNVSRVLLNRDTPIMNEFRQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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