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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000119`

染色体: Chr06 坐标: 829041-832986 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000119`
名称	SmilChr06G000119
描述	protein SUPPRESSOR OF MAX2 1-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	829041 - 832986 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987664`
GeneID	`130987664`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987664`
原始查询	`LOC130987664`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein SUPPRESSOR OF MAX2 1-like
产物	protein SUPPRESSOR OF MAX2 1-like
Arabidopsis	`AT5G57710` (AT5G57710) Double Clp-N motif-containing P-loop nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835878] identity=48.2; qcov=1.09; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0250900` (SMAX1L) - identity=41; qcov=1.09; evalue=0; confidence=medium
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity)
KEGG	-
Pfam	PF02861 (Clp_N); PF07724 (AAA_2); PF23569 (NBD_SMAX1); PF26587 (AAA_lid_SMAX1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987664

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057767252.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767252.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767252.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057767252.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057767252.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:829329`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B45,B73
`Chr6:829337`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B12,B22,C35,C44,D4
`Chr6:829347`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:829393`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,B83
`Chr6:829398`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33
`Chr6:829402`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B27,C37
`Chr6:829541`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr6:829542`	`T`	`TGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	B10,B106,B133,B32,B78,B79,C71,C80
`Chr6:829552`	`C`	`CAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	B10,B106,B133,B32,B78,B79,C71,C80
`Chr6:829554`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	B10,B106,B133,B32,B78,B79,C71,C80
`Chr6:829738`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B22,C44
`Chr6:829765`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,B101,B34,B73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767252.1

933 aa

466

933

Clp_N

NBD_SMAX1

AAA_2

AAA_lid_SMAX1

PF02861 Clp_N 12-111 aa PF23569 NBD_SMAX1 204-343 aa PF07724 AAA_2 648-712 aa PF26587 AAA_lid_SMAX1 835-913 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767252.1`	Pfam	`PF02861`	Clp_N	Family	12	111	7.7e-10	39.8	Clp repeat (R) N-terminal domain
`XP_057767252.1`	Pfam	`PF23569`	NBD_SMAX1	Domain	204	343	8.4e-22	78.7	SMAX1 nucleotide binding domain
`XP_057767252.1`	Pfam	`PF07724`	AAA_2	Domain	648	712	5.3e-08	33.8	AAA domain (Cdc48 subfamily)
`XP_057767252.1`	Pfam	`PF26587`	AAA_lid_SMAX1	Domain	835	913	1.9e-22	79.6	SMAX1-like, AAA+ ATPase lid domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911269.1
AATTAAAAAGAGATTACAACTGAAAGTAGGTCAGTTTCACTCCATCTGCCAATAAAGCATATATCTCTCCAGAAATCCTTGCATCTGAAAGTACTTCTTCTTCCCATCTCCCCATTTTCCATAAATTCCTTCTTCAAAATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAATAAAAACAAAAGAAAACCAAGAACACTGCATGCTCTCTTTCTCTGACATATTCCACTTTTAACACGTTTGGCTTTTTTCTCCCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987664
ATGAGGGCCGGATTGAGCACGATTCAGCAGACGCTGACGCCGGAGGCGTCGGCCATCCTGAGCCAGTCCATCGCGGAGGCGCGCCGCCGCAACCACGGGCAGACGACGCCGCTGCACGTGGCGGCGGCGCTGCTGTCGTCGCCGTCGGGGTACCTCCGGCAGGCCTGCATCCGGTCCCACCCGAACTCGAGCCACCCGCTGCAGTGCCGCGCGCTGGAGCTCTGCTTCAGCGTGGCCCTCGAGCGCCTCCCCACGGCGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767252.1
MRAGLSTIQQTLTPEASAILSQSIAEARRRNHGQTTPLHVAAALLSSPSGYLRQACIRSHPNSSHPLQCRALELCFSVALERLPTAQKAAAEPPISNALMAALKRAQAHQRRGCPEQQQQPLLAVKVELDQLIVSILDDPSVSRVMREASFSSPAVKSAVEHSSAAASLNYAPPALFANPPPLSHNRNAYLNPRLQPPPPEAAKVVEIMRRSKKRNPILVGDSEPAAVVRDLLRKVESHDEIFKSVSVVSMEKGISMEEL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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