Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000122`

染色体: Chr06 坐标: 862739-863483 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000122`
名称	SmilChr06G000122
描述	protein GLUTAMINE DUMPER 5-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	862739 - 863483 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987667`
GeneID	`130987667`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987667`
原始查询	`LOC130987667`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein GLUTAMINE DUMPER 5-like
产物	protein GLUTAMINE DUMPER 5-like
Arabidopsis	`AT4G31730` (GDU1) glutamine dumper 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829301] identity=55.2; qcov=0.702; evalue=1.8e-25; confidence=medium
Rice	`Os08g0446800` - identity=47.5; qcov=0.952; evalue=5.03e-25; confidence=medium
GO	GO:0080143 (regulation of amino acid export)
KEGG	-
Pfam	PF27655 (GDU_TM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987667

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057767257.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767257.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767257.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767257.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057767257.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:863015`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,C25,C34,D1
`Chr6:863053`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr6:863180`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,B73,B83,B85
`Chr6:863271`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr6:863291`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B112
`Chr6:863291`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B112
`Chr6:863309`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767257.1

124 aa

124

GDU_TM

PF27655 GDU_TM 20-65 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767257.1`	Pfam	`PF27655`	GDU_TM	Domain	20	65	6.8e-20	71.4	Glutamine dumper transmembrane helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911274.1
CATAAAACCAATATTTAAGGGGGATAAAAAAAAAAGGAAAATAGCATGATCCACCATTCCTTTCTCTTTTTCACCTTATATAAATGCTCACTCCAAGCTCACGTAGTTCACCACTCCACCACCACCACCACCACTGGCGGCAGCGGCGGCGGATCACTTCTTCTCTTTCCAACTCCTTCACACAAGACTCATATCATAACGGAGCCGTGTCATCGCTCAAATCTCCATACACATACAAACTAGAAAAAGGAAATGGCCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987667
ATGGCCTCGGCGGCGGAACCGGCGGCGCCACCGTCGCCATCTTCATGGCAGTCGCCGGTGCCGTACCTATTCTGCGGGCTGGCAGCCATGCTGGGCCTCATAGCTTTTGCTCTCCTTATATTGGGCTGCTCCTACTGGAAATTCCACGGGATCAGCCGCCAAAGAAGGGACGTCGAAGCACACGGCGGCGCAAAGGCGGCGCCGCCGGTGTTTGTAGAGAGGTATCTGGTGATCATGGCGGGGCAGGAGAAGCCAACTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767257.1
MASAAEPAAPPSPSSWQSPVPYLFCGLAAMLGLIAFALLILGCSYWKFHGISRQRRDVEAHGGAKAAPPVFVERYLVIMAGQEKPTFLATPTSPFGSFRCGTSQTSLALEKNIQPHQSQLHQFQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

JBrowse

跳转到基因组浏览器