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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000157`

染色体: Chr06 坐标: 1097293-1098918 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000157`
名称	SmilChr06G000157
描述	RING-H2 finger protein ATL43-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	1097293 - 1098918 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987703`
GeneID	`130987703`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987703`
原始查询	`LOC130987703`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RING-H2 finger protein ATL43-like
产物	RING-H2 finger protein ATL43-like
Arabidopsis	`AT5G05810` (ATL43) RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830466] identity=38.4; qcov=0.973; evalue=4.62e-52; confidence=medium
Rice	`Os06g0695900` - identity=57.1; qcov=0.381; evalue=1.04e-49; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00097 (zf-C3HC4); PF12678 (zf-rbx1); PF12861 (zf-ANAPC11); PF13639 (zf-RING_2); PF13923 (zf-C3HC4_2); PF17123 (zf-RING_11)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987703

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057767309.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767309.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767309.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767309.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057767309.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:1097796`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B95,C34,C77,C87,D8
`Chr6:1097813`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr6:1097857`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B106,B28,B35,B84
`Chr6:1097884`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B68
`Chr6:1097884`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B68
`Chr6:1097888`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:1097891`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:1097915`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:1097943`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr6:1097958`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B138,B48,D5
`Chr6:1098038`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,B135,B59
`Chr6:1098053`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767309.1

367 aa

184

367

zf-RING_11

zf-C3HC4_2

zf-RING_2

zf-C3HC4

zf-rbx1

zf-ANAPC11

PF17123 zf-RING_11 119-148 aa PF13923 zf-C3HC4_2 119-161 aa PF13639 zf-RING_2 119-162 aa PF00097 zf-C3HC4 120-161 aa PF12678 zf-rbx1 131-162 aa PF12861 zf-ANAPC11 132-164 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767309.1`	Pfam	`PF17123`	zf-RING_11	Domain	119	148	1.9e-09	37.7	RING-like zinc finger
`XP_057767309.1`	Pfam	`PF13923`	zf-C3HC4_2	Domain	119	161	4.2e-08	33.6	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)
`XP_057767309.1`	Pfam	`PF13639`	zf-RING_2	Domain	119	162	4.1e-14	53.3	Ring finger domain
`XP_057767309.1`	Pfam	`PF00097`	zf-C3HC4	Domain	120	161	5.3e-07	30.1	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)
`XP_057767309.1`	Pfam	`PF12678`	zf-rbx1	Domain	131	162	4.7e-09	37.1	RING-H2 zinc finger domain
`XP_057767309.1`	Pfam	`PF12861`	zf-ANAPC11	Domain	132	164	7.6e-06	26.6	Anaphase-promoting complex subunit 11 RING-H2 finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911326.1
TGCAAAAATATAGGTGTTTATAGTTAGTCATAAGTGGCATATGAAGAAACCGAAAAACATGCCGAAAAAGTCACTTCTATGTATCTCTCTACCTATCTACAAGGCAGCACGAAATCTTCCTTAATCTTATTTTTAGGAATCGTTTGTGTAAATGAAGCTACAAAAATATTATCAACAAAATCACTACTATACAAGGTAAACTAATTAATGGTAGAAGCAATGTCACTAGTCACACCAACCATGTGTCATATATTTGAATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987703
ATGGGTGTGCCCAATTTGTGGCCCTGCATCTCCCTCCTTGTTCTCTCAATCGAGACGTCGGCATCCGCCAGAAGAATCGCGCAGGAAGACGAATATTACAACAAGCTTCCTCCGCCGCCGTCGCCGACGGCCCCGGCCGTGTTCAAGCCGGGCACGACCGTGATCGTGGCGGCGATCAGCGCCGTCTTCACGATCACCTTCATGCTCCTCCTCTACGTGCAGCGCTGCAAGACCGCGGCGGGCTCCCGGGCGACCCTCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767309.1
MGVPNLWPCISLLVLSIETSASARRIAQEDEYYNKLPPPPSPTAPAVFKPGTTVIVAAISAVFTITFMLLLYVQRCKTAAGSRATLPLARVDSGVNRKVIQQLPLFRFASLRGQKDGLECAVCLTRFEAEEVLRLLPKCKHAFHVECVDTWLDRHSTCPLCRYRVRPEDVLLIDCHGNGRQKALHNYRPSVDRVSAAAGSSRHSSAGERSARTSGGTGMRRRSSFDAWSSRRRSSGRLSVNLSRRDERPGAHGDKDTHRL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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