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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000163`

染色体: Chr06 坐标: 1137949-1142389 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000163`
名称	SmilChr06G000163
描述	cationic amino acid transporter 2, vacuolar-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	1137949 - 1142389 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987709`
GeneID	`130987709`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987709`
原始查询	`LOC130987709`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cationic amino acid transporter 2, vacuolar-like
产物	cationic amino acid transporter 2%2C vacuolar-like
Arabidopsis	`AT1G58030` (CAT2) cationic amino acid transporter 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842170] identity=65.6; qcov=0.997; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0623500` (OsCAT11) - identity=62.4; qcov=0.967; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0006865 (amino acid transport); GO:0015171 (amino acid transmembrane transporter activity); GO:0016020 (membrane); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00324 (AA_permease); PF13520 (AA_permease_2); PF13906 (AA_permease_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987709

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057767324.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	1.00000	`XP_057767324.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767324.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767324.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767324.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:1138274`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B130,C16,C40,C61
`Chr6:1138994`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,B129,B31
`Chr6:1139120`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,B69
`Chr6:1139157`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr6:1139183`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B41,C33,C38,C5
`Chr6:1139385`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B58
`Chr6:1139396`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr6:1139417`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,A16
`Chr6:1139520`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B126,B4,B72,C4
`Chr6:1139571`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:1139572`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr6:1139577`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B126,B27,B83,C25,C78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767324.1

633 aa

316

633

AA_permease

AA_permease_2

AA_permease_C

PF00324 AA_permease 51-419 aa PF13520 AA_permease_2 52-429 aa PF13906 AA_permease_C 551-600 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767324.1`	Pfam	`PF00324`	AA_permease	Domain	51	419	2.4e-41	142.6	Amino acid permease
`XP_057767324.1`	Pfam	`PF13520`	AA_permease_2	Family	52	429	5.7e-56	190.9	Amino acid permease
`XP_057767324.1`	Pfam	`PF13906`	AA_permease_C	Domain	551	600	1.5e-16	60.9	C-terminus of AA_permease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911341.1
ATTCATTGGAAACCATGCTATCACATTCTCTCTCTCAGAGTCCCTTTCTCTCACCTCAACTAAATTTCTGCAACGCCGGACCCACGTGGTGATCACCCAATCTTCCCCATATCATTAATGATTAGCTTTTCAAGAATATCCTTTTTATTGTAGTATAAAGTTTTCTCATCACCTCAAAGAACGAACCTTTTCCAAGATTTTTTGGTGGGCACTGAGCTTTGATGATTGGAGCTGCTGGTTAGGAATATTCATAAAGTTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987709
ATGGGCTTCCCTTGTGATGGAGCAGAGAAAAATGGCGGCGGCGGAGGTGGGAGTTTGAACACACTCGTGAGGAGGAAGCAGGTTGATTCTAAGCATGTTTCCTCATCTGGGACTCGCCAAAATCAATTGGCCAGGGCTCTCACTGCACCTCATCTCATCGCCATAGGAGTCGGCGCGACGATTGGTTCGGGTGTTTACATTCTGGTTGGCACAGTTGCTAGAGAGCATTCAGGGCCAGCTCTTACACTTTCATTTCTCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767324.1
MGFPCDGAEKNGGGGGGSLNTLVRRKQVDSKHVSSSGTRQNQLARALTAPHLIAIGVGATIGSGVYILVGTVAREHSGPALTLSFLIAGIAAGLSAFCYAELASRCPSAGSAYHYSYICIGEVVAWLVGWALMLEYTIGGSAVARGISPNLALLFGGPDSLPSLLARQTIPGVDIVVDPCAAIIVVLVTALLCLGIKESAFAQGIVTSVNVCALIFVIVAGGYLGFKTGWRGYELPAGYFPFGAKGMLAGASTVFFAYTG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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