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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000168`

染色体: Chr06 坐标: 1159763-1171695 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000168`
名称	SmilChr06G000168
描述	CDT1-like protein a, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	1159763 - 1171695 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987714`
GeneID	`130987714`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987714`
原始查询	`LOC130987714`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	CDT1-like protein a, chloroplastic
产物	CDT1-like protein a%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT2G31270` (CDT1A) CDT1-like protein A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817684] identity=40; qcov=1.04; evalue=7.34e-101; confidence=medium
Rice	`Os04g0185100` (OSJNBa0001M07.6) - identity=36.7; qcov=0.868; evalue=8.08e-85; confidence=medium
GO	GO:0000076 (DNA replication checkpoint signaling); GO:0000278 (mitotic cell cycle); GO:0003677 (DNA binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0030174 (regulation of DNA-templated DNA replication initiation); GO:0070182 (DNA polymerase binding); GO:0071163 (DNA replication preinitiation complex assembly)
KEGG	-
Pfam	PF08839 (CDT1); PF16679 (CDT1_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987714

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057767332.1`
2	Chromosome	染色体	1.00000	`XP_057767332.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057767332.1`
4	Spindle	Spindle	0.20000	`XP_057767332.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767332.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:1159819`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B36,C38
`Chr6:1159831`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B102,B133,B89,C14,C29
`Chr6:1159872`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr6:1159889`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:1159910`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B66,B98,C12
`Chr6:1159932`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B67,C15
`Chr6:1159952`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B34,C83
`Chr6:1159969`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,B51
`Chr6:1160029`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:1160031`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:1160090`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:1160386`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B42

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767332.1

575 aa

288

575

CDT1

CDT1_C

PF08839 CDT1 106-222 aa PF16679 CDT1_C 456-546 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767332.1`	Pfam	`PF08839`	CDT1	Domain	106	222	1.1e-13	52.4	DNA replication factor CDT1 like
`XP_057767332.1`	Pfam	`PF16679`	CDT1_C	Domain	456	546	1.7e-20	74.1	DNA replication factor Cdt1 C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911349.1
GCTTCACCTTCACTGTGTGTGTTTGAGCAGAGCCATGGATGCCAGTAAACAGTCGCCGCTGCCTTCTTCGTTCAAGTCGAAGAAGCTTCTGAGTTCGCCTGCGCCGTCGGATCGGAAGGTTTCTGACCCGAACCCGGACCCGCTGAGCGTGAAGACCCCCGGGAAGCCGGCGGACCAGCCGCGGAGGCTGCGCAACCGCGGCGTGGCTCTGTCGATTTCGGATGTCAGGAAAGCGGCGATGAAGCTCCGGGAGCGGGGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987714
ATGGATGCCAGTAAACAGTCGCCGCTGCCTTCTTCGTTCAAGTCGAAGAAGCTTCTGAGTTCGCCTGCGCCGTCGGATCGGAAGGTTTCTGACCCGAACCCGGACCCGCTGAGCGTGAAGACCCCCGGGAAGCCGGCGGACCAGCCGCGGAGGCTGCGCAACCGCGGCGTGGCTCTGTCGATTTCGGATGTCAGGAAAGCGGCGATGAAGCTCCGGGAGCGGGGATCCGATCCGCCTGCGAGGACCGACGCGGTTTCGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767332.1
MDASKQSPLPSSFKSKKLLSSPAPSDRKVSDPNPDPLSVKTPGKPADQPRRLRNRGVALSISDVRKAAMKLRERGSDPPARTDAVSISEEEEIAELKKPAAAEIELPAKYELLEKFFNSLDSSIRLLQLKRSATTFSNISPQIGTLTDRRFTYSHLAQLKFILPEAIVLEKTLQHDERTSCMKPDLRITLDVEAIKRKGKSKSGNLQLRKVFRSRLLDFFKSHPEGDEVPEEVLPEPFNRSKGGPSTNSARPSGTSSTGP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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