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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000174`

染色体: Chr06 坐标: 1204193-1205160 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000174`
名称	SmilChr06G000174
描述	stigma-specific STIG1-like protein 2
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	1204193 - 1205160 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987721`
GeneID	`130987721`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987721`
原始查询	`LOC130987721`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	stigma-specific STIG1-like protein 2
产物	stigma-specific STIG1-like protein 2
Arabidopsis	`AT1G50720` (AT1G50720) Stigma-specific Stig1 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841494] identity=45.6; qcov=1.03; evalue=2.68e-42; confidence=medium
Rice	`Os01g0248000` - identity=39.3; qcov=0.772; evalue=6.91e-13; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04885 (Stig1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987721

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057767351.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767351.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767351.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767351.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057767351.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:1204700`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B25,B7
`Chr6:1204778`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B84
`Chr6:1204790`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,C27
`Chr6:1204852`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C74,C86
`Chr6:1204857`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B62,C53,C82
`Chr6:1204899`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr6:1204907`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B140,B9,C43,C83
`Chr6:1204910`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B140,B55,B9,C43,C83
`Chr6:1204950`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:1204963`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr6:1204989`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B55,B84
`Chr6:1205006`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B29,C25,D1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767351.1

145 aa

145

Stig1

PF04885 Stig1 62-145 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767351.1`	Pfam	`PF04885`	Stig1	Family	62	145	3.6e-25	89.0	Stigma-specific STIG1-like protein family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911368.1
CCTCAATTTTCTCTCACTTTTCCCAATTCATCTCAAAATCAAAAAAAGAGATTACAAACTCAAGAAGAGTTACAAACAATACCTAAAATTTCCTCCTTTGATCCTCCACCACCTTCAAAAAAAAAATGAAGGTGATCAAAGTCATATTTTCCCTCATTGCCTTCGTCGTGGCCGTAACCCTAATCCTCACGGCAAATGACACCGGCCCCACGCCTTCCCCTCCACCACCCTCTCCTCTCTCCAAACCGGCCGCCACAACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987721
ATGAAGGTGATCAAAGTCATATTTTCCCTCATTGCCTTCGTCGTGGCCGTAACCCTAATCCTCACGGCAAATGACACCGGCCCCACGCCTTCCCCTCCACCACCCTCTCCTCTCTCCAAACCGGCCGCCACAACTCGTGTCAGCCGGTTCCTCCAGGAGAAGGGGAAAAACCCTAGGGCCGCCGACCACTGCCACAAGGACAACGACGTGTGCAACAACACGTTGGAAGACGGGCGGAACGCCACGTGTTGCAACAACAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767351.1
MKVIKVIFSLIAFVVAVTLILTANDTGPTPSPPPPSPLSKPAATTRVSRFLQEKGKNPRAADHCHKDNDVCNNTLEDGRNATCCNNKCLDLQYDDKNCGACKKKCAFTETCCRGECVMLAYDKRHCGTCNKKCAKFCLYGMCSYA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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