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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000177`

染色体: Chr06 坐标: 1241099-1243151 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000177`
名称	SmilChr06G000177
描述	WUSCHEL-related homeobox 11-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	1241099 - 1243151 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987723`
GeneID	`130987723`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987723`
原始查询	`LOC130987723`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	WUSCHEL-related homeobox 11-like
产物	WUSCHEL-related homeobox 11-like
Arabidopsis	`AT5G17810` (WOX12) WUSCHEL related homeobox 12 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831649] identity=45; qcov=0.996; evalue=3.26e-55; confidence=high
Rice	`Os08g0242400` (OsWOX10) - identity=42.9; qcov=1; evalue=7.1e-46; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0048830 (adventitious root development)
KEGG	-
Pfam	PF00046 (Homeodomain)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987723

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057767352.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767352.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767352.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057767352.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057767352.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:1241265`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,C14,C22,C73
`Chr6:1241297`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B6
`Chr6:1241297`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B6
`Chr6:1241404`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,B109,B122,B4,C44
`Chr6:1241498`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:1241515`	`GC`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B56,B93,B96
`Chr6:1241605`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,B118
`Chr6:1241664`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	25	A16,A4,B105,B134,B139,B33,B4,B54,B67,B69,B8,B87,B90,B92,C1,C15,C21,C35,C40,C45,C5,C54,C82,C83,C87
`Chr6:1241667`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	24	A16,A4,B105,B134,B139,B33,B4,B54,B67,B69,B8,B90,B92,C1,C15,C21,C35,C40,C45,C5,C54,C82,C83,C87
`Chr6:1241675`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr6:1241698`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr6:1242164`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767352.1

266 aa

133

266

Homeodomain

PF00046 Homeodomain 29-89 aa

XP_057767353.1

261 aa

130

261

Homeodomain

PF00046 Homeodomain 29-89 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767352.1`	Pfam	`PF00046`	Homeodomain	Domain	29	89	1.3e-10	41.6	Homeodomain
`XP_057767353.1`	Pfam	`PF00046`	Homeodomain	Domain	29	89	1.3e-10	41.7	Homeodomain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911369.1
TGTACCACCATTGATGTCGACACTAGTGAAGCTAGCTTACTTCAAATTCAACCCCTCTCCAATTTCTCCAAATCCAAACAAAACAAAAAACCTCCACCAAAAATCATGGAGGATCCGGCCCGCGCCACCGGCGGCTCCCGGCAGCAGCACCACGGCGGCGGAGGCGGCGACGCCTCGGAGCAGCCGGTGCGGTCGCGGTGGACGCCGAAGCCGGAGCAAATCCTGATCCTCGAGACCATCTTCAACAGCGGCATGGTCAA...

XM_057911370.1
GTACCACCATTGATGTCGACACTAGTGAAGCTAGCTTACTTCAAATTCAACCCCTCTCCAATTTCTCCAAATCCAAACAAAACAAAAAACCTCCACCAAAAATCATGGAGGATCCGGCCCGCGCCACCGGCGGCTCCCGGCAGCAGCACCACGGCGGCGGAGGCGGCGACGCCTCGGAGCAGCCGGTGCGGTCGCGGTGGACGCCGAAGCCGGAGCAAATCCTGATCCTCGAGACCATCTTCAACAGCGGCATGGTCAAC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130987723
ATGGAGGATCCGGCCCGCGCCACCGGCGGCTCCCGGCAGCAGCACCACGGCGGCGGAGGCGGCGACGCCTCGGAGCAGCCGGTGCGGTCGCGGTGGACGCCGAAGCCGGAGCAAATCCTGATCCTCGAGACCATCTTCAACAGCGGCATGGTCAACCCCCCCAAAGACGAGACCGTCCGAATCCGGAAGCTTCTAGAGAAGTTCGGCTCCGTCGCCGACGCCAACGTCTTCTACTGGTTCCAGAACCGCCGCTCCCGCTC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057767352.1
MEDPARATGGSRQQHHGGGGGDASEQPVRSRWTPKPEQILILETIFNSGMVNPPKDETVRIRKLLEKFGSVADANVFYWFQNRRSRSRRRQRQVQATLAADQPPPSRRLPAHHYDQHGFAPPAAANFPPNSFSYAMINSASSSSSSSSSFGLEADDGGADNSGCGGFGFSPYPGLMHELEQNPIFGAAEAPTSQIQPPEKYAEMMTVFFNGVATEVGRGPVDIKSMFGGDFAVFHSSGMAMEANEYGFLVHGLQHGESYF...

XP_057767353.1
MEDPARATGGSRQQHHGGGGGDASEQPVRSRWTPKPEQILILETIFNSGMVNPPKDETVRIRKLLEKFGSVADANVFYWFQNRRSRSRRRQRQVQATLAADQPPPSRRLPAHHYDQHGFAPPAAANFPPNSFSYAMINSASSSSSSSSSFGLEADDGGADNSGCGGFGFSPYPGLMHELEQNPIFGAAEAPTSQIQPQMMTVFFNGVATEVGRGPVDIKSMFGGDFAVFHSSGMAMEANEYGFLVHGLQHGESYFLVPKL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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