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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000179`

染色体: Chr06 坐标: 1252412-1256258 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000179`
名称	SmilChr06G000179
描述	UBP1-associated protein 2A-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	1252412 - 1256258 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987724`
GeneID	`130987724`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987724`
原始查询	`LOC130987724`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	UBP1-associated protein 2A-like
产物	UBP1-associated protein 2A-like
Arabidopsis	`AT3G56860` (UBA2A) UBP1-associated protein 2A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824853] identity=48.8; qcov=0.794; evalue=1.06e-102; confidence=high
Rice	`Os01g0265800` (RBP-P) - identity=50.9; qcov=0.704; evalue=9.52e-97; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987724

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057767354.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057767354.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767354.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767354.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057767354.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:1255022`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B23,C80,C86
`Chr6:1255027`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr6:1255040`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B120,B94,C78
`Chr6:1255151`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B120,B94,C78
`Chr6:1255443`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr6:1255544`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C41
`Chr6:1255728`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B32,C37
`Chr6:1255788`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C56
`Chr6:1255810`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B128,B97,C31
`Chr6:1255828`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B23,B25,C80,C86
`Chr6:1255934`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr6:1255936`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767354.1

480 aa

240

480

RRM_1

PF00076 RRM_1 158-216 aa PF00076 RRM_1 258-326 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767354.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	158	216	1.3e-30	105.8	RNA recognition motif
`XP_057767354.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	258	326	1.3e-30	105.8	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911371.1
ATTCAGAAAAAGAAAATAATTTGATGAGAAACCCTCGTCGCCGTCGTTATAACCAGTGATTCTCAACTCAGTGCACAAATCCTGCACAGTCAATTCACCTCACATGGCGAAGAAGCGGAAGCTCAAAGCGGGACCCTCACAAATTGAAGAGGAAGAGGAAATCGTCGCCGAAGAAGAAGACATCGGCGACGATGACGAAGACGAAATTGAGTACGAAGAAGTTGAGTATGAAGAAGAAGAAGAGGAGGAAGAATACGAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987724
ATGGCGAAGAAGCGGAAGCTCAAAGCGGGACCCTCACAAATTGAAGAGGAAGAGGAAATCGTCGCCGAAGAAGAAGACATCGGCGACGATGACGAAGACGAAATTGAGTACGAAGAAGTTGAGTATGAAGAAGAAGAAGAGGAGGAAGAATACGAAGAGGAAGAGGAAGAAGAAGCGGACGCTGAAGTAGACGATCCACACAACAGCAGCAGCGTTGGGGAGAAGCCAATCCTGAGCAACGATGTTGGTGTCGACGCGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767354.1
MAKKRKLKAGPSQIEEEEEIVAEEEDIGDDDEDEIEYEEVEYEEEEEEEEYEEEEEEEADAEVDDPHNSSSVGEKPILSNDVGVDASTIPSNNDGRGKTPVQSNNNGDEVEEEPIHSVLAAFSKEKLVELLAEAAHRHADVAARVRADADADPSNRKIFVHSLNWDTAEETLFEEFAKYGEIEDCRLVTDKITGQSKGYGFVLFKTCRAARQALKEPQKLIDRRMTSSQLASVGPIAAGSPLPRKLQQPMPGYTQRKIFV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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