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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000178`

染色体: Chr06 坐标: 1248152-1251334 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000178`
名称	SmilChr06G000178
描述	uncharacterized SmilChr06G000178
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	1248152 - 1251334 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987725`
GeneID	`130987725`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987725`
原始查询	`LOC130987725`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phytochrome kinase substrate 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830297]; symbol=PKS4; hit=AT5G04190; species=arabidopsis; confidence=low
产物	phytochrome kinase substrate 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830297]; symbol=PKS4; hit=AT5G04190; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G04190` (PKS4) phytochrome kinase substrate 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830297] identity=29.1; qcov=0.807; evalue=3.19e-09; confidence=low
Rice	`-` -
GO	GO:0009638 (phototropism)
KEGG	-
Pfam	PF30823 (PKS)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987725

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057767355.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057767355.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057767355.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057767355.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767355.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:1248473`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr6:1248484`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr6:1248535`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:1248682`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C5,C79,D9
`Chr6:1248749`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr6:1248881`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B120,B93,C37,D6
`Chr6:1248885`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr6:1248890`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr6:1248975`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr6:1248990`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr6:1249101`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr6:1249128`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	frameshift_variant	16	A19,A9,B118,B12,B125,B89,B90,B92,C1,C19,C24,C53,C61,C7,C78,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767355.1

311 aa

156

311

PKS

PF30823 PKS 5-108 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767355.1`	Pfam	`PF30823`	PKS	Family	5	108	8.8e-15	55.4	Phytochrome kinase substrate protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911372.1
GAGACAAAAACCTAAATGAGCGCCATTGACGATGTCGAAATCAGCATTTTTGACGCTGCCAAGTATTTCAACGAAGGATTGAACGACGTGAAGAGACAAGTAGATGAGAAGAAGGTGACGAATCATCATCATCTTCTTCAGCCATCGGTTTCTTCTCCGGCGGAATTAGGGCGGAAGAAATCCTCGGCGCTGTCGGAGGCCAGCTGGAGCAGCCAAATCGCTCTCCTCACCGCAAGCCGGAGGTGGTCCGCCGCTAAGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987725
ATGAGCGCCATTGACGATGTCGAAATCAGCATTTTTGACGCTGCCAAGTATTTCAACGAAGGATTGAACGACGTGAAGAGACAAGTAGATGAGAAGAAGGTGACGAATCATCATCATCTTCTTCAGCCATCGGTTTCTTCTCCGGCGGAATTAGGGCGGAAGAAATCCTCGGCGCTGTCGGAGGCCAGCTGGAGCAGCCAAATCGCTCTCCTCACCGCAAGCCGGAGGTGGTCCGCCGCTAAGAGGTGGTTTTTGAGGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767355.1
MSAIDDVEISIFDAAKYFNEGLNDVKRQVDEKKVTNHHHLLQPSVSSPAELGRKKSSALSEASWSSQIALLTASRRWSAAKRWFLRRRRRNCCCSNGESIRVKEVIARPIVLMDTVKSKASHADADADADADADDVVEIRQIRASDAPRQQRISATGRPFISAAAAVGFTFPILSSAAREDDAGSDASSDLFEIETFSAQTPSSLSSCPIHCLCDSHAERKFTPPSNVHRSRLSAATAAGCDGELEENAAASRPTQEEAG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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