当前解析结果
SmilChr06G000184| 统一新 Gene ID | SmilChr06G000184 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G000184 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G000184 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 1272280 - 1274241 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130987731 |
|---|---|
| GeneID | 130987731 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130987731 |
| 原始查询 | LOC130987731 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os01g0810200; species=rice; confidence=high |
| 产物 | hit=Os01g0810200; species=rice; confidence=high |
| Arabidopsis | AT3G56820 (AT3G56820)RmlC-type cupin [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824849] identity=57.7; qcov=0.86; evalue=2.06e-68; confidence=high |
| Rice | Os01g0810200- identity=52; qcov=0.826; evalue=2.09e-70; confidence=high |
| GO | GO:0005768 (endosome); GO:0005802 (trans-Golgi network) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF14667 (Polysacc_synt_C) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130987731 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.80000 | XP_057767361.1 |
| 2 | Golgi apparatus | 高尔基体 | 0.80000 | XP_057767361.1 |
| 3 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 0.60000 | XP_057767361.1 |
| 4 | Vacuole | 液泡 | 0.20000 | XP_057767361.1 |
| 5 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057767361.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057767361.1PF14667
Polysacc_synt_C 139-215 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057767361.1 |
Pfam | PF14667 |
Polysacc_synt_C | Domain | 139 | 215 | 3.4e-07 | 31.1 | Polysaccharide biosynthesis C-terminal domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。