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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000188`

染色体: Chr06 坐标: 1302907-1306336 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000188`
名称	SmilChr06G000188
描述	uncharacterized SmilChr06G000188
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	1302907 - 1306336 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987734`
GeneID	`130987734`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987734`
原始查询	`LOC130987734`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ELMO/CED-12 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821208]; symbol=AT3G03610; hit=AT3G03610; species=arabidopsis; confidence=high
产物	ELMO/CED-12 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821208]; symbol=AT3G03610; hit=AT3G03610; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G03610` (AT3G03610) ELMO/CED-12 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821208] identity=66; qcov=1; evalue=3.41e-160; confidence=high
Rice	`Os03g0322800` - identity=62.8; qcov=1.01; evalue=7.17e-149; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04727 (ELMO_CED12)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987734

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	0.80000	`XP_057767366.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057767366.1`
3	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.60000	`XP_057767366.1`
4	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057767366.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767366.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:1303279`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,B32
`Chr6:1303502`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,B34
`Chr6:1303769`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B109,B66,B94
`Chr6:1304667`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,B138,B89
`Chr6:1304745`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B69,C87
`Chr6:1304747`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C85
`Chr6:1304747`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C85
`Chr6:1305837`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr6:1305912`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24
`Chr6:1305936`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B58,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767366.1

321 aa

160

321

ELMO_CED12

PF04727 ELMO_CED12 127-291 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767366.1`	Pfam	`PF04727`	ELMO_CED12	Family	127	291	2.3e-50	171.8	ELMO/CED-12 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911383.1
AGGATTTTAATTTCTTTCTTAGCTCCGAAGGTAGCAAGTAGAGTGCAATACGCAACACACCGAAAAACCCTTTACTAAAATTGGTTAAATATTGAATTAGGGTTTCAGTGAATCACTATTTATCCAAGCTTTTCCCCTAATTCGTTGATCACTCCATTTCTCCTCTGCTCCAATTCTGCTCGGACGCCGCCGTTTTGATGAGTTCCCGTACACTGAGAAGACGGCTGCACCACGGAGATATTGATGGCGGAAGACACGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987734
ATGAGTTCCCGTACACTGAGAAGACGGCTGCACCACGGAGATATTGATGGCGGAAGACACGATCGTTGCGAGACTTCGGCATTGGATGCGTTGAGCGAACCGTTGCTGGCAGATGGAGATTATGATTATAATAAACACAATGAGGGGACCTCGCTTGTGGATATTTTGGATGAACAGCGACGTAAAGAGGATCTGCATTGGACACTAGTATTCTCGAACGTGATTGCGCAGTGGGCTCAATGGTTAGCAAATATTGTTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767366.1
MSSRTLRRRLHHGDIDGGRHDRCETSALDALSEPLLADGDYDYNKHNEGTSLVDILDEQRRKEDLHWTLVFSNVIAQWAQWLANIVLGSGSLLARIVPFISGNQNGANNLLPPVLLSPLQEARLKYLKQRLSVPFDGTCSDHQDALRQLWRLAYPDRQLPALKSVLWKDMGWQGSDPSTDFRGGGFISLENLIFFAKTYPEAFQNLLHKRDGDRSEWEYPFAVAGINISFMLVQMLDLQSGNPSKLAGQRFLQMLSYDDM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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