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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000197`

染色体: Chr06 坐标: 1359366-1361751 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000197`
名称	SmilChr06G000197
描述	leucine-rich repeat protein 1-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	1359366 - 1361751 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987741`
GeneID	`130987741`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987741`
原始查询	`LOC130987741`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	leucine-rich repeat protein 1-like
产物	leucine-rich repeat protein 1-like
Arabidopsis	`AT5G21090` (AT5G21090) Leucine-rich repeat (LRR) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832233] identity=78; qcov=1; evalue=2.08e-118; confidence=high
Rice	`Os01g0279800` (PHT4;1) probable anion transporter 1, chloroplastic [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:4326905] identity=82.1; qcov=0.888; evalue=7.64e-114; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF08263 (LRRNT_2); PF13855 (LRR_8); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987741

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057767375.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767375.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767375.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767375.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057767375.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:1359567`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B121
`Chr6:1359575`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C2,C68
`Chr6:1359748`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B120
`Chr6:1360239`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B17,B63,B69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767375.1

214 aa

107

214

LRRNT_2

LRR_14

LRR_1

LRR_8

LRR_1

PF08263 LRRNT_2 24-63 aa PF23598 LRR_14 72-169 aa PF00560 LRR_1 91-113 aa PF13855 LRR_8 91-150 aa PF00560 LRR_1 115-137 aa PF00560 LRR_1 139-159 aa PF00560 LRR_1 164-180 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767375.1`	Pfam	`PF08263`	LRRNT_2	Family	24	63	3.3e-12	47.2	Leucine rich repeat N-terminal domain
`XP_057767375.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	72	169	4.5e-13	49.4	Leucine-rich repeat region
`XP_057767375.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	91	113	5.1e-16	56.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057767375.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	91	150	8.2e-10	39.0	Leucine rich repeat
`XP_057767375.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	115	137	5.1e-16	56.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057767375.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	139	159	5.1e-16	56.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057767375.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	164	180	5.1e-16	56.1	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911392.1
TAAAAAGGACTAAATATCTAATTTTCTTTAATAAAAAGATATAAATCAGTATTTACTTTCCACACAAAAAATATAGAAAAAAAAAAACCTTACTTTTTCGGAATGATTGCCATTCCTCAAAAACCGATCAAACTAGGAAAAAGATTCGATTTCTACTGATTGTTTGCGATTCTTCAAGAATCCAATTCCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTGCAACATTGCACCAATCAATTCCGCTAACGAAGAGCTTATGGCTGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987741
ATGGCTGCCATTGGTTTGCTCCTAATCATAGCCCTAACCGTCGCTTCGTCGGTGCCGGCGGCGCGTGGGAATTCCGAGGTCGACGCGCTCTACGCGCTTCGCCGGAGCTTGATCGACCCGAGGAAGGTGCTCCAGAGCTGGGATCCGAACCTCGTGAGCCCTTGCACCTGGTTCCATGTCACCTGCAATCAAGATAACCGCGTCACCCGCGTGGACCTTGGCAACTCGAATTTGTCTGGTCATCTAGTGCCTGAGCTTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767375.1
MAAIGLLLIIALTVASSVPAARGNSEVDALYALRRSLIDPRKVLQSWDPNLVSPCTWFHVTCNQDNRVTRVDLGNSNLSGHLVPELGKLEHLQYLELYKNNIQGAIPAELGKLKSLISLDLYNNNISGIIPPSLGNLKSLVFLRLNDNRLNGPIPRVLTGISTLKVVDVSNNNLCGTIPTTGSFEHIPLNNFENNPRLEGPELQGLASYDTNCS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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