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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000204`

染色体: Chr06 坐标: 1395868-1397622 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000204`
名称	SmilChr06G000204
描述	probable cytochrome c oxidase subunit 5C-1
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	1395868 - 1397622 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987752`
GeneID	`130987752`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987752`
原始查询	`LOC130987752`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable cytochrome c oxidase subunit 5C-1
产物	probable cytochrome c oxidase subunit 5C-1
Arabidopsis	`AT3G62400` (AT3G62400) cytochrome C oxidase subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825413] identity=75; qcov=1; evalue=3.01e-33; confidence=medium
Rice	`Os12g0561000` (COX5C) - identity=73; qcov=0.984; evalue=2.12e-31; confidence=medium
GO	GO:0005746 (GO:0005746)
KEGG	-
Pfam	PF30944 (COX5C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987752

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057767387.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	1.00000	`XP_057767387.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	0.60000	`XP_057767387.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767387.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767387.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:1396128`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B14
`Chr6:1396131`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B110,C15
`Chr6:1396131`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B110,C15
`Chr6:1396170`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr6:1396182`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C34

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767387.1

64 aa

COX5C

PF30944 COX5C 23-47 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767387.1`	Pfam	`PF30944`	COX5C	Family	23	47	4.7e-17	61.9	Cytochrome c oxidase subunit 5C

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911404.1
GCTAATTTGATAGTACAAGGTATAGTGATGATACGACGCCGTTGCTCCTCGATACAACCTTCTCTCCACTTTTATTCAGCCCTATATTCTGAAATAAGAATTCAGACCTATTCCCCAATCTCGCAATCGGAGAATTAATTCTAGGATTCTACGGAACGAAAGCGCCGCAGATTTCGATTCTGGTGTTTGATTTTGTGGATCTAAGCATCCAAGGAAGAACTTAAAATGGCTGGTCATAGAGTTGCCCACGCCACTTTGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987752
ATGGCTGGTCATAGAGTTGCCCACGCCACTTTGAAGGGACCAAGCGTTGTCAAGGAGATACTCATTGCCACTGCACTTGGCATCGCTGCTGGCAGTGTGTGGAAGATGCACCACTGGAATGAGCAGCGAAAGGTTAGGGCTTTCTACGACATGCTAGATAAAGGTGAAATCACTGTGGTTGCTGCAGAAGAATAG

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767387.1
MAGHRVAHATLKGPSVVKEILIATALGIAAGSVWKMHHWNEQRKVRAFYDMLDKGEITVVAAEE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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