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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000211`

染色体: Chr06 坐标: 1423470-1426365 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000211`
名称	SmilChr06G000211
描述	transcription factor IIIA-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	1423470 - 1426365 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987759`
GeneID	`130987759`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987759`
原始查询	`LOC130987759`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor IIIA-like
产物	transcription factor IIIA-like
Arabidopsis	`AT1G72050` (TFIIIA) transcription factor IIIA [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843536] identity=50.5; qcov=0.99; evalue=6.72e-137; confidence=high
Rice	`Os05g0121400` (OJ1001_G01.7) - identity=53.5; qcov=0.857; evalue=1.24e-126; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II)
KEGG	-
Pfam	PF00096 (zf-C2H2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987759

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057767401.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057767401.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767401.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767401.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057767401.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:1423499`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B16,C39,C48,D7
`Chr6:1423521`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	A8,B69,C19
`Chr6:1423521`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	3	A8,B69,C19
`Chr6:1423535`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B102,B75,B95,C26
`Chr6:1423570`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	26	A21,A23,A3,B101,B131,B15,B16,B40,B44,B45,B60,B66,B73,B91,B94,B99,C39,C4,C44,C48,C49,C54,C86,D10,D11,D7
`Chr6:1423615`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr6:1423889`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr6:1423961`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B113,B84,C6
`Chr6:1423972`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,B13,B18,B48,C81
`Chr6:1424001`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr6:1424968`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,C85
`Chr6:1425341`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,B18,B48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767401.1

406 aa

203

406

zf-C2H2

PF00096 zf-C2H2 112-132 aa PF00096 zf-C2H2 138-162 aa PF00096 zf-C2H2 203-227 aa PF00096 zf-C2H2 294-318 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767401.1`	Pfam	`PF00096`	zf-C2H2	Domain	112	132	6.6e-17	61.6	Zinc finger, C2H2 type
`XP_057767401.1`	Pfam	`PF00096`	zf-C2H2	Domain	138	162	6.6e-17	61.6	Zinc finger, C2H2 type
`XP_057767401.1`	Pfam	`PF00096`	zf-C2H2	Domain	203	227	6.6e-17	61.6	Zinc finger, C2H2 type
`XP_057767401.1`	Pfam	`PF00096`	zf-C2H2	Domain	294	318	6.6e-17	61.6	Zinc finger, C2H2 type

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911418.1
TGCCCCTCCATTTTTCTTATATATTCAGCCCTAACCACTGACACTGTATCTCCTCTTAGCTCAGTCGCAGCCTACGCGCCTCCAGTTTTCGACCTTCTCATCATCTACACACCTATACTGTATTTCCATATACGTATCGCAATGGCGGCGGAGGAAGTAGAGAAGGCGCGAGATTCGATTTTCCGAGACATCAGGAGATATTACTGTGAGTTCTGTGGAATTTGCCGATCGAAGAAAGTCCTAATCGCCGCTCACATCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987759
TGCCCCTCCATTTTTCTTATATATTCAGCCCTAACCACTGACACTGTATCTCCTCTTAGCTCAGTCGCAGCCTACGCGCCTCCAGTTTTCGACCTTCTCATCATCTACACACCTATACTGTATTTCCATATACGTATCGCAATGGCGGCGGAGGAAGTAGAGAAGGCGCGAGATTCGATTTTCCGAGACATCAGGAGATATTACTGTGAGTTCTGTGGAATTTGCCGATCGAAGAAAGTCCTAATCGCCGCTCACATCCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767401.1
CPSIFLIYSALTTDTVSPLSSVAAYAPPVFDLLIIYTPILYFHIRIAMAAEEVEKARDSIFRDIRRYYCEFCGICRSKKVLIAAHIRTHHEEEIEENELNEEKEHGEKLNLCEECGASFRKPAHLKQHMQSHSLERPFVCSVDDCHSSYRRKDHLTRHMLQHQGKLFECTFEGCKVTFTIQGNMTRHVKEFHDGSASAEVKQHVCSEHGCGKVFKYLSKLKKHEDSHVKLDSVEAFCADSGCMKYFSNEQCLKEHIRSCH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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