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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000210`

染色体: Chr06 坐标: 1418496-1423358 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000210`
名称	SmilChr06G000210
描述	aladin
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	1418496 - 1423358 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987760`
GeneID	`130987760`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987760`
原始查询	`LOC130987760`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aladin
产物	aladin
Arabidopsis	`AT3G56900` (AT3G56900) Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824857] identity=67.3; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0129400` (OsWD40-192) - identity=61.5; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005643 (nuclear pore); GO:0006913 (nucleocytoplasmic transport)
KEGG	smil03013 (Nucleocytoplasmic transport - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00400 (WD40); PF25460 (Beta-prop_Aladin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987760

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057767402.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767402.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767402.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767402.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057767402.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:1419517`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B13,B49,C26
`Chr6:1419798`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr6:1419804`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	23	A10,A13,A5,B101,B113,B115,B27,B47,B48,B49,B61,B67,B74,B78,B81,B92,C13,C19,C20,C33,C62,C66,C71
`Chr6:1419839`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,C85
`Chr6:1419886`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B75,B95,C26,C77
`Chr6:1420781`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B22
`Chr6:1420781`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B22
`Chr6:1421302`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,A20,C75
`Chr6:1421320`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:1421342`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B2
`Chr6:1421342`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr6:1421357`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B69,C19

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767402.1

442 aa

221

442

Beta-prop_Aladin

WD40

PF25460 Beta-prop_Aladin 101-434 aa PF00400 WD40 204-238 aa PF00400 WD40 256-278 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767402.1`	Pfam	`PF25460`	Beta-prop_Aladin	Repeat	101	434	2.7e-58	198.5	Aladin seven-bladed propeller
`XP_057767402.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	204	238	6.1e-10	39.9	WD domain, G-beta repeat
`XP_057767402.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	256	278	6.1e-10	39.9	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911419.1
CACAGAGCACCCTGGCGGGAACTAAACCAAAAATCACTATAAACCCTACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAGTTACGCCAACTCCACACCTCCAGACACGATGCCTTCTTTCCCTCAGCCAGGCACGGTCACCATTTGCGAAATCAACAGAGAACTAGTTACGGCAGACCACCTCGGCGATGATCAAGCGAAGGATACTTACGCTAAAATCCTCGGGACTGTATTCAGTCCGATCCCTTTCGAATCAGACAGCTTATTAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987760
ATGCCTTCTTTCCCTCAGCCAGGCACGGTCACCATTTGCGAAATCAACAGAGAACTAGTTACGGCAGACCACCTCGGCGATGATCAAGCGAAGGATACTTACGCTAAAATCCTCGGGACTGTATTCAGTCCGATCCCTTTCGAATCAGACAGCTTATTAGGGACGGGGACTGAGCAGGAATCAGTTGAACGGAGGAAGGGTAGTTTAGATATTCTATCTGCGGCACTAGAGGCTCTGTTGAGTGGCTCCCTCAGGCCTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767402.1
MPSFPQPGTVTICEINRELVTADHLGDDQAKDTYAKILGTVFSPIPFESDSLLGTGTEQESVERRKGSLDILSAALEALLSGSLRPLLQPADVKLLNGIDLHSVSWHDHKQILAFVSAPHQVTICDYNDSDGKSPCILSHESQKDVKILEWRPNGGKTLSVACKGGICIWAASSPGNIPPVRSGVTSNPLSRGSVTRWTLVDFLQSSDSEQITALSWSPDGRYLASASYESSSFTIWDVSQGLGTPIRRGLGGISLLKWS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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