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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000213`

染色体: Chr06 坐标: 1427391-1430389 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000213`
名称	SmilChr06G000213
描述	uncharacterized SmilChr06G000213
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	1427391 - 1430389 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987761`
GeneID	`130987761`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987761`
原始查询	`LOC130987761`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0000725 (recombinational repair)
KEGG	-
Pfam	PF15072 (HROB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987761

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057767403.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057767403.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767403.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057767403.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057767403.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:1427649`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,B136,B81,C15
`Chr6:1427673`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C36,D11,D6
`Chr6:1427720`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr6:1427839`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,B18,B48,C81
`Chr6:1427873`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr6:1428145`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:1429399`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B126
`Chr6:1429626`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B102,B139,B22,B97,C38
`Chr6:1429667`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr6:1429695`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	D11
`Chr6:1429695`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	D11
`Chr6:1429712`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,A13,C10,C73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767403.1

412 aa

206

412

HROB

PF15072 HROB 144-229 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767403.1`	Pfam	`PF15072`	HROB	Domain	144	229	8.1e-28	97.0	Homologous recombination OB-fold protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911420.1
AATGCCTGATTTATTTATAGAATTGCGAAGTTGTCGACCCGAACCGGAAACCGTATCCGTAAACCCATACCCATATATCCGAATTGGTCACATCCATAATACTGTACAGTTTTCCCTCCAATACTGAATAGTCAAAAATGGAGCTGGAGCCCTGGGAAGCTTTAGATCTCGACGATTCCGACCTTCCTTCTCTCCTCCGCCCCTGCAAACGACGACGTTCCTCCTCTCCTGCCGCCTCCGACAACCCTCCTTTGCAGCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987761
ATGGAGCTGGAGCCCTGGGAAGCTTTAGATCTCGACGATTCCGACCTTCCTTCTCTCCTCCGCCCCTGCAAACGACGACGTTCCTCCTCTCCTGCCGCCTCCGACAACCCTCCTTTGCAGCCAGCGCTCGAGCAACTACCAGCTTCCTCCTCGCGCCGCCCCGCTATTCCCGGCCCCGCCGGAGCTGTCCACGCCGCGATGCTCCGCAAAAATCACGACCGCGAGAATCACAATGTCTCCGACCATGATAATGGTAACGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767403.1
MELEPWEALDLDDSDLPSLLRPCKRRRSSSPAASDNPPLQPALEQLPASSSRRPAIPGPAGAVHAAMLRKNHDRENHNVSDHDNGNDGLLSTQDYIRKAMDDTAEFDDDFSRHPWLSALQFLGTADGLIPSTPISSIKKCFNGDKVDQVVAVVKSCTPNGLGGLLVSLKDPTGTIGASIHHKVLSQTEFGKELTTGAVLILQKVAIFAPVRSARYLNVTTRNLVKVFCRNKGSTSELHKSVQPVQYADPDIESSRKARAV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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