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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000215`

染色体: Chr06 坐标: 1435126-1443331 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000215`
名称	SmilChr06G000215
描述	outer envelope protein 64, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	1435126 - 1443331 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987763`
GeneID	`130987763`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987763`
原始查询	`LOC130987763`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	outer envelope protein 64, chloroplastic
产物	outer envelope protein 64%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G17970` (TOC64-III) translocon at the outer membrane of chloroplasts 64-III [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819660] identity=67.2; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0707900` - identity=62.7; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF01425 (Amidase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987763

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057767406.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.40000	`XP_057767406.1`
3	Mitochondrion outer membrane	线粒体外膜	0.40000	`XP_057767406.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057767406.1`
5	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.20000	`XP_057767406.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:1435551`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C56,C65
`Chr6:1435796`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B52,C75,D2
`Chr6:1436625`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:1436723`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B123,B87,D9
`Chr6:1438587`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B52,C75,D2
`Chr6:1438669`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B75,B95,C26,C77
`Chr6:1438702`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B16,B94,C30,C5
`Chr6:1439838`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,C44,C61
`Chr6:1439929`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B52,C75,D2
`Chr6:1439938`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,B18,B48,C16,C81
`Chr6:1440210`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B124,B140,B93,C51
`Chr6:1442026`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B128,B14,B31,B8,C3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767406.1

589 aa

294

589

Amidase

PF01425 Amidase 55-217 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767406.1`	Pfam	`PF01425`	Amidase	Domain	55	217	1.9e-46	159.8	Amidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911423.1
GAATATGGTATTCTGGGGTGAATAGCTAAAAAGATAAAATGGGAGTGAAGAGTTATTTTCCCTAAAATTATAAAAACATAAAAATCTTGATAAACCCCAATGCAAAATTCTCACCTCAAAGTCTCAAACACCCCAAAATTCGCACTCTCGCCTAGGTTTTCTCCTATATCCTCGCTCAACTATCTAATCTAATTTATTTATTCACAACATACAATAGCAATTGATCAGCTGAACGGCTGAATTCTTGAAAATCCTGCAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987763
ATGGCGTCTTCATCAGCGAATTTGTGGGTTTTATTAGGGCTTGGGATTGCGGGGATATTGATTATGACGAAGAAGCTGAAGCGGGCGGTGAGGGCTGATTTCGGAGCGTTTATAGAGCGGTTGCAGCTGTTGCCGCCGCCGCAGCCCGCCCCTCCCAAAGCTCCTCACCCTCTCACTGGCCTATCTTTTGCGGTTTCTGATGTATTTAACATTGAAGGATTTGTTACTGGGTTTGGCAACCCAGACTGGTCCAGCGCTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767406.1
MASSSANLWVLLGLGIAGILIMTKKLKRAVRADFGAFIERLQLLPPPQPAPPKAPHPLTGLSFAVSDVFNIEGFVTGFGNPDWSSAHEPATRTCPVVAALVDGGATCVGKTVVDDMALGVSGENKHYDTPTNPAAPARVPGGASSGAAVAVAAKLVEFSLGIDTDGGVRLPAGNCAVLGFRPSHGTVSLSGVITVSESLDTVGWFAKDPSVLRRVGHVLLQVPYAAQRNPRTFVIADDCFQLTKVPADRTQVVIKSIEKL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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