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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000222`

染色体: Chr06 坐标: 1479072-1482562 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000222`
名称	SmilChr06G000222
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	1479072 - 1482562 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987769`
GeneID	`130987769`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987769`
原始查询	`LOC130987769`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
Arabidopsis	`AT5G35450` (AT5G35450) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833508] identity=26.58; qcov=0.92; evalue=1.92e-61; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=29.53; qcov=0.777; evalue=1.03e-57; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987769

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057767415.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057767415.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:1479685`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C4,C56,C65
`Chr6:1479760`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr6:1479792`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr6:1479813`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:1479855`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr6:1479879`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B120
`Chr6:1479984`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr6:1480040`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B107
`Chr6:1480071`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C70,C83
`Chr6:1480181`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,B33,B69
`Chr6:1480337`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr6:1480473`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B107

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767415.1

865 aa

432

865

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

PF00931 NB-ARC 157-325 aa PF23559 WHD_DRP 409-477 aa PF23598 LRR_14 548-811 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767415.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	157	325	6.5e-39	134.0	NB-ARC domain
`XP_057767415.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	409	477	1.2e-10	42.0	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057767415.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	548	811	5.7e-14	52.4	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911432.1
GCTACAAACAACCAAATCCCTCCACCAAAACACTGTCACCATCTCTTCCACATTTTCAATTTCTAGAAATAAAAATCAGTTCTTTACAGTTCCGATTTTGGCATGTTGCAGAAGTGAATTTGATCGTTCCCCCTTTTTCCCCAACAGCTAAGCAAGTGGAATTCCACTCAGATTCTTTATTATTTTATGCTCCCACCAATTCATAGGGGCAAATGATGAAGACTTCGAACTGTCCTCTTCGTTTTGCTTTGACTATTTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080392.1_cds_XP_057767415.1_30778
ATGGCTTATGCTGCTTTGATTTCTCTTAAACATACTATCAACCGCCTGCTGTATTCTTCTGCCATTTCGATTGTTTCCCCTGGTTTAGGAATGATAAGATCTGCCTACCGTGAATTGCGCTTCTTGGAAGGAGTTGTGAAAAGATTAGATAGCAGAAGCAGCATTGGGAGAGAGAATGGTGGTGATGATGAAGAAGATGTGGAGAGAAGGATCAGAGAGGCAGTGTTCAAACTAGAGGATGCACTCGAATTCTATGCATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767415.1
MAYAALISLKHTINRLLYSSAISIVSPGLGMIRSAYRELRFLEGVVKRLDSRSSIGRENGGDDEEDVERRIREAVFKLEDALEFYASDQFESRGDEGCPLMLSLDSEAVHLEMESFTEMVKIVKNYSEEFVSHEEDEYAAAASEVVKSEMVGLADELRRIRSSLTTWMTDQLCVASLEGMAGVGKTTLAKEAFDDPFVCQYFDIRVWISVGEKYQLKRIILSILAQIDLCIDRDVREGDEELIECLNESLKGRRYLIVLD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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