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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000239`

染色体: Chr06 坐标: 1601068-1603778 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000239`
名称	SmilChr06G000239
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	1601068 - 1603778 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987784`
GeneID	`130987784`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987784`
原始查询	`LOC130987784`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
Arabidopsis	`AT1G50180` (AT1G50180) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841440] identity=29.7; qcov=1; evalue=3.07e-71; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=29.3; qcov=0.963; evalue=1.66e-71; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987784

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057767442.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057767442.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767442.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767442.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767442.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:1601482`	`TAC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	11	A18,B137,B19,B52,C10,C45,C5,C75,C79,C85,D2
`Chr6:1601494`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr6:1601563`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B52,B61,C10,D9
`Chr6:1601653`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C7,C71
`Chr6:1601718`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:1601723`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,C51
`Chr6:1601793`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B19,C25,C28
`Chr6:1601815`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B34,B65,C27,C67,C71
`Chr6:1601815`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B34,B65,C27,C67,C71
`Chr6:1601886`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,B119,B18
`Chr6:1601930`	`C`	`CCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	43	A10,A15,A5,A9,B106,B118,B128,B132,B136,B139,B14,B16,B18,B20,B26,B27,B3,B37,B43,B49,B59,B63,B7,B72,B73,B79,B83,B88,C10,C15,C21,C36,C39,C4,C42,C43,C46,C57,C6,C72,C85,C87,D8
`Chr6:1601931`	`AAT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	43	A10,A15,A5,A9,B106,B118,B128,B132,B136,B139,B14,B16,B18,B20,B26,B27,B3,B37,B43,B49,B59,B63,B7,B72,B73,B79,B83,B88,C10,C15,C21,C36,C39,C4,C42,C43,C46,C57,C6,C72,C85,C87,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767442.1

751 aa

376

751

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 20-190 aa PF23559 WHD_DRP 271-340 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767442.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	20	190	2.6e-40	138.5	NB-ARC domain
`XP_057767442.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	271	340	5.1e-21	75.2	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911459.1
TAGCTGTTGACGGACTGGGAGAAAAAGAAAAATCCAATTTTCCAAGGTTTAATCTTTCTGAAGTTCCTTCAAAAAAAAAAAAAAATCTTTTTGAAGTAATTCACAAAAGCGAACAGCAATGCAGATCCAAAGCAGCATGAACAATCCAAGGCCCTCTGATTGCATTATTGGGATCGAAGAAGACTTGCTGAAGATAAAGAATGAGCTCTGTGGAGGATCATCCCAGCTTAGAGTAATCCCCATTGTTGGGATGGGAGGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987784
ATGCAGATCCAAAGCAGCATGAACAATCCAAGGCCCTCTGATTGCATTATTGGGATCGAAGAAGACTTGCTGAAGATAAAGAATGAGCTCTGTGGAGGATCATCCCAGCTTAGAGTAATCCCCATTGTTGGGATGGGAGGCATCGGGAAAACCACTCTTGCTAGGTATGCTTACCACGACCCTCTGAGTGTTCATCGCTTTGATCTATGCGTTTGGTTAACAATATCTCAAAGATTTCAATTAAGGGAAATTCTTGTTAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767442.1
MQIQSSMNNPRPSDCIIGIEEDLLKIKNELCGGSSQLRVIPIVGMGGIGKTTLARYAYHDPLSVHRFDLCVWLTISQRFQLREILVSALCSLENLDEEAYHYADDELLKETLYKCLKGRRYLVVMDDMWDTDVWDDLRGIFPDDRNGSRIIVTTRELSVASYIDSLHPHQMQLMAVDQSWRLLKERVFGNGDCPLEFVEIGQVIAQNCRGLPLAVVVIAGVLSCEANWEEIARNVSKVVHTNDEKFIEILSLSYEYLPGR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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