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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000262`

染色体: Chr06 坐标: 1752077-1755827 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000262`
名称	SmilChr06G000262
描述	uncharacterized SmilChr06G000262
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	1752077 - 1755827 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987792`
GeneID	`130987792`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987792`
原始查询	`LOC130987792`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Cysteine/Histidine-rich C1 domain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827919]; symbol=AT4G02540; hit=AT4G02540; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Cysteine/Histidine-rich C1 domain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827919]; symbol=AT4G02540; hit=AT4G02540; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G02540` (AT4G02540) Cysteine/Histidine-rich C1 domain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827919] identity=26; qcov=0.867; evalue=9.92e-33; confidence=low
Rice	`Os07g0610200` - identity=30.2; qcov=0.292; evalue=7.36e-10; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03107 (C1_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987792

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057767450.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057767450.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767450.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767450.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767450.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:1752253`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	17	A15,A23,B10,B107,B131,B32,B38,B39,B4,B5,B54,B84,C16,C39,C80,D10,D11
`Chr6:1752254`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	17	A15,A23,B10,B107,B131,B32,B38,B39,B4,B5,B54,B84,C16,C39,C80,D10,D11
`Chr6:1752337`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B140,B34
`Chr6:1752359`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,B107
`Chr6:1752413`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr6:1752479`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,B4,C39,C60
`Chr6:1752510`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,A24,B135,B68,B73
`Chr6:1752516`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	15	B137,B20,B60,B63,B75,B83,B86,B87,B93,B99,C29,C80,D10,D6,D9
`Chr6:1752524`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	15	B137,B60,B63,B75,B83,B86,B87,B93,B99,C29,C80,D10,D4,D6,D9
`Chr6:1752534`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B93,C29,D6,D9
`Chr6:1752539`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:1752580`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	B106,B39,B50,B6,B60,B84,B86,C45,C7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767450.1

648 aa

324

648

C1_2

PF03107 C1_2 74-123 aa PF03107 C1_2 140-186 aa PF03107 C1_2 199-248 aa PF03107 C1_2 467-514 aa PF03107 C1_2 525-573 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767450.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	74	123	1.6e-52	176.3	C1 domain
`XP_057767450.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	140	186	1.6e-52	176.3	C1 domain
`XP_057767450.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	199	248	1.6e-52	176.3	C1 domain
`XP_057767450.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	467	514	1.6e-52	176.3	C1 domain
`XP_057767450.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	525	573	1.6e-52	176.3	C1 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911467.1
AAAGTTGCCACTTACCTTTTTTTTTTTCTTCTTTGTTTTTGTTGTTCTGTTTTAATAAGATGCAGGAATTGTATGTGTGTGTTAATACTTGCTGTTAAGAGAGAAAGAAAGTAGAGATGGGTGATGAGGAGATTATTCCTCATATGTTTCATGAACACCCGCTGACTCTGATCCCCAACCCGGCCGCGGAAACAGATTATTCTTGGGCCAATTTGTGTTATGGTTGTCGGAGATACTTTTTAGCAGGAGAGGCAGTCTAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987792
ATGGGTGATGAGGAGATTATTCCTCATATGTTTCATGAACACCCGCTGACTCTGATCCCCAACCCGGCCGCGGAAACAGATTATTCTTGGGCCAATTTGTGTTATGGTTGTCGGAGATACTTTTTAGCAGGAGAGGCAGTCTATGGATGCAGCCAAAAGTGTGGATTTCTTGGGCTATTACACAAAGAATGCATGGAAATGCCGAGAGAGATCCGCCATCCTCTCCACCCTTCACACTCACTCACACTACAACACTCTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767450.1
MGDEEIIPHMFHEHPLTLIPNPAAETDYSWANLCYGCRRYFLAGEAVYGCSQKCGFLGLLHKECMEMPREIRHPLHPSHSLTLQHSLYDDIINRCAVCEGYYVVELCYKCIGGCEFLIHLRCAGGFDEAVVDDNPTIKHPSHPQHLLKFSKKTRWCSFPCDACGATHKGNSYICTICDYWIHESCALLPESAHFPHHRPDHSLSLAFHTPYEYILYYFVCAICSGPLRMRCWIYHCQICSYVVHINCASLSPSDSFNNEI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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