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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000244`

染色体: Chr06 坐标: 1632640-1636392 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000244`
名称	SmilChr06G000244
描述	B3 domain-containing protein Os02g0598200-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	1632640 - 1636392 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987794`
GeneID	`130987794`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987794`
原始查询	`LOC130987794`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	B3 domain-containing protein Os02g0598200-like
产物	B3 domain-containing protein Os02g0598200-like
Arabidopsis	`AT3G18960` (AT3G18960) AP2/B3-like transcriptional factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821429] identity=37.8; qcov=0.171; evalue=1.98e-10; confidence=weak
Rice	`Os02g0598200` - identity=31.8; qcov=0.308; evalue=5.05e-17; confidence=low
GO	GO:0003677 (DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF02362 (B3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987794

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057767454.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057767454.1`
3	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057767454.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767454.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057767454.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:1632719`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr6:1632771`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B135,B88,C19,C26
`Chr6:1633865`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr6:1633953`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A15
`Chr6:1634074`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,B135
`Chr6:1634119`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B137,B31,C75
`Chr6:1634169`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B129,B7,C39,D6
`Chr6:1634224`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:1634327`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:1634596`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,B9,C43
`Chr6:1634600`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,B135
`Chr6:1634628`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,B135

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767454.1

573 aa

286

573

PF02362 B3 17-106 aa PF02362 B3 482-570 aa

XP_057767455.1

572 aa

286

572

PF02362 B3 17-106 aa PF02362 B3 481-569 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767454.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	17	106	1.4e-23	83.4	B3 DNA binding domain
`XP_057767454.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	482	570	1.4e-23	83.4	B3 DNA binding domain
`XP_057767455.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	17	106	1.4e-23	83.4	B3 DNA binding domain
`XP_057767455.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	481	569	1.4e-23	83.4	B3 DNA binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911471.1
TCGTGGTTTAGTTAACAGTTTTGAAACAGATCACTTTTACAACCAAGTGAGAAGAAGATGGTTCGAAGAGGTTGTCGCACCAGCAAACACGAGAGCTCTCATCGATTCTTCAAAGTCATGTTTGGCAAGAACCACTCAAAATTTATGTACTTGCCTCCGAAGTTTGCGCAAAGAGTGAAGCACTTGTTGACTAATCAAAAAACTGAACTTAAGGATTCACTTGGGCAGCGATGGTCTGTAACACTGTCTCTTGTCGATGG...

XM_057911472.1
TCGTGGTTTAGTTAACAGTTTTGAAACAGATCACTTTTACAACCAAGTGAGAAGAAGATGGTTCGAAGAGGTTGTCGCACCAGCAAACACGAGAGCTCTCATCGATTCTTCAAAGTCATGTTTGGCAAGAACCACTCAAAATTTATGTACTTGCCTCCGAAGTTTGCGCAAAGAGTGAAGCACTTGTTGACTAATCAAAAAACTGAACTTAAGGATTCACTTGGGCAGCGATGGTCTGTAACACTGTCTCTTGTCGATGG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130987794
ATGGTTCGAAGAGGTTGTCGCACCAGCAAACACGAGAGCTCTCATCGATTCTTCAAAGTCATGTTTGGCAAGAACCACTCAAAATTTATGTACTTGCCTCCGAAGTTTGCGCAAAGAGTGAAGCACTTGTTGACTAATCAAAAAACTGAACTTAAGGATTCACTTGGGCAGCGATGGTCTGTAACACTGTCTCTTGTCGATGGAGCCCTTGCATTCCAAATGGGTTGGGAAGAGTTTTATCTATACCATGGTCTCAAAGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057767454.1
MVRRGCRTSKHESSHRFFKVMFGKNHSKFMYLPPKFAQRVKHLLTNQKTELKDSLGQRWSVTLSLVDGALAFQMGWEEFYLYHGLKEGQLLLFKYKESHFTVRIFGTSACERTNFNNEMPGRRKKRKRCQGTTSEDEAHQTAGVKSDISISASGDESQNRITKLAVDLSFEMENGTFDAKKAEGAVIKLLDASTETEQRDVFDNASDKGLSLSSNWVLEPTNPAGRDEDAQMGVIETDLITRTTGDDAMEQTKTTAEDAQ...

XP_057767455.1
MVRRGCRTSKHESSHRFFKVMFGKNHSKFMYLPPKFAQRVKHLLTNQKTELKDSLGQRWSVTLSLVDGALAFQMGWEEFYLYHGLKEGQLLLFKYKESHFTVRIFGTSACERTNFNNEMPGRRKKRKRCQGTTSEDEAHQTAGVKSDISISASGDESQNRITKLAVDLSFEMENGTFDAKKAEGAVIKLLDASTETEQRDVFDNASDKGLSLSSNWVLEPTNPAGRDEDAQMGVIETDLITRTTGDDAMEQTKTTAEDAQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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