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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000246`

染色体: Chr06 坐标: 1641358-1643323 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000246`
名称	SmilChr06G000246
描述	GRAS family protein RAD1-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	1641358 - 1643323 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987800`
GeneID	`130987800`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987800`
原始查询	`LOC130987800`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GRAS family protein RAD1-like
产物	GRAS family protein RAD1-like
Arabidopsis	`AT5G17490` (RGL3) RGA-like protein 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831615] identity=40.5; qcov=0.782; evalue=3.62e-82; confidence=medium
Rice	`Os03g0707600` (SLR1) - identity=38.2; qcov=0.816; evalue=1.72e-76; confidence=medium
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF03514 (GRAS)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987800

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057767466.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057767466.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767466.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767466.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057767466.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:1641419`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B71,C65,C83
`Chr6:1641435`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr6:1641509`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:1641512`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,C61,C9
`Chr6:1641549`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B17,B97
`Chr6:1641575`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B5,C53
`Chr6:1641611`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:1641661`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,B93,C51
`Chr6:1641681`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B25
`Chr6:1641776`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B40,B78,C48,D7
`Chr6:1641827`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C48,D7
`Chr6:1641833`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767466.1

490 aa

245

490

GRAS

PF03514 GRAS 119-489 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767466.1`	Pfam	`PF03514`	GRAS	Family	119	489	9.1e-114	381.0	GRAS domain family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911483.1
CAGATCCCATGGCTTATAGCTTCCTCCCCCAAGATTCCTTCGATGACGACTTCAAGAATTTCCCCATTTTCGAGGACGTCATCGGCGCAATCTGGCTGCCGAGCTTGCACGACGGCGCCGGCGACTTCAAGAGGCAGAAGAAAACCACGAGCTTGACCGAACTCAGCGACGGCGGCGGCGGCGGCGGCTCCGTTTCCATCCCGCGCAACGGCAGCGCCGCCAGCTTGACCAGCAGCGGCCCGCAAATCCGGGACCGCATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987800
ATGGCTTATAGCTTCCTCCCCCAAGATTCCTTCGATGACGACTTCAAGAATTTCCCCATTTTCGAGGACGTCATCGGCGCAATCTGGCTGCCGAGCTTGCACGACGGCGCCGGCGACTTCAAGAGGCAGAAGAAAACCACGAGCTTGACCGAACTCAGCGACGGCGGCGGCGGCGGCGGCTCCGTTTCCATCCCGCGCAACGGCAGCGCCGCCAGCTTGACCAGCAGCGGCCCGCAAATCCGGGACCGCATCAAGACGTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767466.1
MAYSFLPQDSFDDDFKNFPIFEDVIGAIWLPSLHDGAGDFKRQKKTTSLTELSDGGGGGGSVSIPRNGSAASLTSSGPQIRDRIKTYSQLYLEAEALAAEDGGRGGEGAEGGNADGTKLVQQLISCAEAVACRDRAHASLLLSELRANALVFGSAFQRVASCFVQGLADRLAMVQPLGAVGYAAPTMNIMDAASEKREEALRLVYDMCPYIRFGHFVANAAILEAFEGERLVHVVDLGMTLGLPQGHQWQNLIHSLAKRP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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