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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000247`

染色体: Chr06 坐标: 1645693-1646946 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000247`
名称	SmilChr06G000247
描述	stemmadenine O-acetyltransferase-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	1645693 - 1646946 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987808`
GeneID	`130987808`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987808`
原始查询	`LOC130987808`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	stemmadenine O-acetyltransferase-like
产物	stemmadenine O-acetyltransferase-like
Arabidopsis	`AT1G24430` (AT1G24430) HXXXD-type acyl-transferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839059] identity=39.9; qcov=0.973; evalue=5.05e-90; confidence=medium
Rice	`Os04g0500700` (OsHCT1) hydroxycinnamoyltransferase 1-like [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:4336306] identity=25.8; qcov=0.995; evalue=2.44e-33; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02458 (Transferase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987808

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057767474.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057767474.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057767474.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767474.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767474.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:1645709`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B40,B78,C48,D7
`Chr6:1645709`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B40,B78,C48,D7
`Chr6:1645732`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,B67,C45
`Chr6:1645741`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B53
`Chr6:1645793`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B110,C52,C8
`Chr6:1645817`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B24,B5,B80,C83
`Chr6:1645979`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B140,B50,C39
`Chr6:1645983`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr6:1645991`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr6:1646032`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B105,B140,C18,C55,C74
`Chr6:1646111`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,A7,C24
`Chr6:1646164`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,B129,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767474.1

402 aa

201

402

Transferase

PF02458 Transferase 1-395 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767474.1`	Pfam	`PF02458`	Transferase	Family	1	395	1.5e-80	271.7	Transferase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911491.1
GCGATAGAGGTGGAGATTATCTCACATGAGATGATTAAGCCTTCATCTCCAACTCCAATCCATCTCAGAAACCTCAAACTCTCATTATTAGACCAAATCGCACCTCCCATTTATGTTCCCCTCATTTTCTTCTACAACCATCATCAACTAACCCTCCAAAACCTCACCCACCACCAAATCTCTCTTCTGCTCAAACAATCTTTATCCAAAACCCTAACTGTATTCTACCCCTTAGCAGGGAGGATTCACGAAAACTCATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987808
ATGATTAAGCCTTCATCTCCAACTCCAATCCATCTCAGAAACCTCAAACTCTCATTATTAGACCAAATCGCACCTCCCATTTATGTTCCCCTCATTTTCTTCTACAACCATCATCAACTAACCCTCCAAAACCTCACCCACCACCAAATCTCTCTTCTGCTCAAACAATCTTTATCCAAAACCCTAACTGTATTCTACCCCTTAGCAGGGAGGATTCACGAAAACTCATCGATCGACTGCAACGATTCGGGCGCTGAGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767474.1
MIKPSSPTPIHLRNLKLSLLDQIAPPIYVPLIFFYNHHQLTLQNLTHHQISLLLKQSLSKTLTVFYPLAGRIHENSSIDCNDSGAEFIEARVHTRALSEIIQDPSMEELKKLQPVEILGQDQKVVLKVKICFFGCGGISVAICMSHKIADGTSLVAFVNAWAASSRGEPQNFQPSFDLASVFPPKDPSELEFTQKIGMTEEKIATKRFVFDKEELEKLRNSESEVKNPTRVEAVSSYIWRRFMDAVKAKDGVKTTSFIAS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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