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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000277`

染色体: Chr06 坐标: 1917843-1922241 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000277`
名称	SmilChr06G000277
描述	UPF0235 protein At5g63440
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	1917843 - 1922241 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987816`
GeneID	`130987816`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987816`
原始查询	`LOC130987816`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	UPF0235 protein At5g63440
产物	UPF0235 protein At5g63440
Arabidopsis	`AT5G63440` (AT5G63440) - identity=86.8; qcov=0.974; evalue=3.64e-124; confidence=high
Rice	`Os07g0295200` (B1120F06.133) - identity=85.7; qcov=0.974; evalue=1.9e-122; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02594 (PF1765-like); PF25809 (STEEP1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987816

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057767481.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057767481.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057767481.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057767483.1`
5	Nucleolus	核仁	0.20000	`XP_057767481.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:1918472`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B44
`Chr6:1918472`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B44
`Chr6:1918485`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,B86
`Chr6:1918582`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr6:1920205`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B19,B89,C16,C57
`Chr6:1922035`	`A`	`ATC`	2bp_insertion	frameshift_variant	6	B115,B16,B20,B81,C48,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767481.1

232 aa

116

232

STEEP1

PF1765-like

PF25809 STEEP1 20-125 aa PF02594 PF1765-like 144-215 aa

XP_057767483.1

194 aa

194

STEEP1

PF1765-like

PF25809 STEEP1 6-87 aa PF02594 PF1765-like 106-177 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767481.1`	Pfam	`PF25809`	STEEP1	Domain	20	125	6.9e-35	119.9	STEEP1 domain
`XP_057767481.1`	Pfam	`PF02594`	PF1765-like	Domain	144	215	5.7e-17	62.4	PF1765 protein family
`XP_057767483.1`	Pfam	`PF25809`	STEEP1	Domain	6	87	5.5e-23	81.6	STEEP1 domain
`XP_057767483.1`	Pfam	`PF02594`	PF1765-like	Domain	106	177	3.9e-17	62.9	PF1765 protein family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911500.1
TTTGGTTACTTTGGTAGTCTATGAAATTTCAAATTATCCCCAAAAATTACTGTAAGCAAGCCCTTCCGAAAACCTGAAGACCTCGATCGCAAAATCCTAAACCATAATTTTCTCTCTACTGCAACAACACATCTCAGATTTTGAAGTTTGAATTTGCATTTGCATTTGTCAGCGGTATATATAGTGTGTACGTCGAGAGAGAGAGATGCCGAAGCGAACGACGCATACGTATTCTAGCGAGGACGCTTTGCCGGAAGGCC...

XM_057911498.1
TGGTTACTTTGGTAGTCTATGAAATTTCAAATTATCCCCAAAAATTACTGTAAGCAAGCCCTTCCGAAAACCTGAAGACCTCGATCGCAAAATCCTAAACCATAATTTTCTCTCTACTGCAACAACACATCTCAGATTTTGAAGTTTGAATTTGCATTTGCATTTGTCAGCGGTATATATAGTGTGTACGTCGAGAGAGAGAGATGCCGAAGCGAACGACGCATACGTATTCTAGCGAGGACGCTTTGCCGGAAGGCCCT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130987816
ATGCCGAAGCGAACGACGCATACGTATTCTAGCGAGGACGCTTTGCCGGAAGGCCCTGATTCCGATCTCTTCGTTTACTACTGCAAGCCTTGCGGCTCCCATGTCCTCATCACCGATACACAATTGCAGAAAATGCCCAAAAGAAAAACAGACAATGCGTATGTTTTGGACAGGAAGAAGCATCTTGCAAGGCTGAATACTAGCGAAGCAGGAAAGATCCTCTTAAAGCGTGGTGAAGGGAAAGTGGAGAGGCAGTATCG...

LOC130987816
ATGTCCTCATCACCGAAAATGCCCAAAAGAAAAACAGACAATGCGTATGTTTTGGACAGGAAGAAGCATCTTGCAAGGCTGAATACTAGCGAAGCAGGAAAGATCCTCTTAAAGCGTGGTGAAGGGAAAGTGGAGAGGCAGTATCGAATGAATTGTGTGGGTTGTGAGCTTTTTGTTTGCTATCGTGCAGAAGAAGACCTGGAGTCTGCTTCGTACATATATGTAGTTGATGGTGCGCTCAGTACAATTGCTGCTGAAAC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057767481.1
MPKRTTHTYSSEDALPEGPDSDLFVYYCKPCGSHVLITDTQLQKMPKRKTDNAYVLDRKKHLARLNTSEAGKILLKRGEGKVERQYRMNCVGCELFVCYRAEEDLESASYIYVVDGALSTIAAETNPQDAPVPPCISQLEGGLVQVAIEVEDRAQRSAITRVNADDVRVTVAAVAARGEANNELLEFMGKVLGLKLSQMTLQRGWNNKSKLLVVEDLTARQVYEKLLEAAQP

XP_057767483.1
MSSSPKMPKRKTDNAYVLDRKKHLARLNTSEAGKILLKRGEGKVERQYRMNCVGCELFVCYRAEEDLESASYIYVVDGALSTIAAETNPQDAPVPPCISQLEGGLVQVAIEVEDRAQRSAITRVNADDVRVTVAAVAARGEANNELLEFMGKVLGLKLSQMTLQRGWNNKSKLLVVEDLTARQVYEKLLEAAQP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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