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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000766`

染色体: Chr01 坐标: 16797503-16798633 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000766`
名称	SmilChr01G000766
描述	uncharacterized SmilChr01G000766
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	16797503 - 16798633 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987819`
GeneID	`130987819`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987819`
原始查询	`LOC130987819`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os12g0292200` - identity=21.8; qcov=0.415; evalue=1.24e-08; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13650 (Asp_protease_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987819

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057767524.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057767524.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057767524.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767524.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767524.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:16797504`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C13
`Chr1:16797504`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C13
`Chr1:16797516`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr1:16797526`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B2,B25,C24,C51
`Chr1:16797530`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr1:16797531`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B94,D10
`Chr1:16797590`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	B104,B2,B25,B60,B86,C15,C24,C51
`Chr1:16797611`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	17	A20,A21,A24,A25,B104,B106,B129,B36,B38,B4,B45,B87,C19,C21,C57,D10,D5
`Chr1:16797626`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr1:16797628`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr1:16797635`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	16	A20,A21,A24,A25,B104,B106,B129,B36,B38,B4,B45,C19,C21,C57,D10,D5
`Chr1:16797645`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767524.1

376 aa

188

376

Asp_protease_2

PF13650 Asp_protease_2 200-290 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767524.1`	Pfam	`PF13650`	Asp_protease_2	Domain	200	290	8.2e-07	30.4	Aspartyl protease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911541.1
ATGGAGTCTCAGTCTGCCACTATCAAGCGTCTTGAGACAACCGTTGGGCAGCTCTTTGGGACCTTGAACCAGATGCAACAGCAGCAACAGCCAGGGAAGCTCCATGGCCAAGGATTGCAGCCCCACCAAGCTCAAGCAGTCACTGTCTTACGCAGTGGAAATGTGGTGAACAACAAAGTGGAAGCCCCTGTGGAAGAACCCCCCAAGGAAGCCCGCATGGAGGAGCAAGTAAAGGAGCCACTGCGGCCAAGAGATGAGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987819
ATGGAGTCTCAGTCTGCCACTATCAAGCGTCTTGAGACAACCGTTGGGCAGCTCTTTGGGACCTTGAACCAGATGCAACAGCAGCAACAGCCAGGGAAGCTCCATGGCCAAGGATTGCAGCCCCACCAAGCTCAAGCAGTCACTGTCTTACGCAGTGGAAATGTGGTGAACAACAAAGTGGAAGCCCCTGTGGAAGAACCCCCCAAGGAAGCCCGCATGGAGGAGCAAGTAAAGGAGCCACTGCGGCCAAGAGATGAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767524.1
MESQSATIKRLETTVGQLFGTLNQMQQQQQPGKLHGQGLQPHQAQAVTVLRSGNVVNNKVEAPVEEPPKEARMEEQVKEPLRPRDEEKEKESEVKLHKAAKPYKPPVPYPSRLKNEKLDQQFTDFYNMLAKVNVNLPLLDVIRNIPAYLKFFKELASKKRRFEDNEKILVSEVANSIMQQPLPPKQRDLGIFVINIALGNGKEASGMLDLGAGINLMPYSIFKQLELGNLKPTRMCLQLADRSVRYPRGVVEDILVRVGG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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