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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002873`

染色体: Chr01 坐标: 47320642-47326735 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002873`
名称	SmilChr01G002873
描述	probable polygalacturonase
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	47320642 - 47326735 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987824`
GeneID	`130987824`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987824`
原始查询	`LOC130987824`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable polygalacturonase
产物	probable polygalacturonase
Arabidopsis	`AT3G42950` (AT3G42950) Pectin lyase-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823351] identity=74.4; qcov=0.949; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0439400` (OsPGL25) - identity=67.3; qcov=0.974; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004650 (polygalacturonase activity); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF00295 (Glyco_hydro_28)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987824

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.60000	`XP_057767506.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057767506.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057767506.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767506.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767506.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:47321099`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,B140,C37
`Chr1:47321225`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B40,B73,B96
`Chr1:47321240`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B12,B18,B91,C18,C60
`Chr1:47321384`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B18,C18,C60
`Chr1:47321442`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B57,C86
`Chr1:47324063`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C23
`Chr1:47325679`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,B140,C37
`Chr1:47325953`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr1:47326049`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr1:47326127`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr1:47326139`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr1:47326177`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767506.1

506 aa

253

506

Glyco_hydro_28

PF00295 Glyco_hydro_28 185-466 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767506.1`	Pfam	`PF00295`	Glyco_hydro_28	Repeat	185	466	4.9e-50	171.2	Glycosyl hydrolases family 28

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911523.1
AGTTATGCACGTGACATGATATAAACAGAAATTGCGAAGAGAAAAAAATGGTGCCAAGAAAAAAAGAAGAAGATAAAATCGGAAACGGAGTAACAGCATATTAGCGTCGTCACCGCTCCTCCAAATCCCATCGGAAAACTGCGTCTGAATCTCACTTGGCTTCTAATACACTTCACTGTCTCAATCCTTTCACCAACACAATTCAAAATCCCACACCCATTACTGCTCCTTGATCGTCACCTTCCACCCTCCAATTCCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987824
ATGGTGGAGACGCTAACCCCCACATCCAGCCCGCCGTGCTTCTGGCGGAGGTCGGCGGCCAACCATCACCACCACCACCGCCGTTGGATCCCAGCCGCCTTCGTCTTCTTCCTGTCCACCCACAAGACCTTCCTCACTGCCCTCTGTCTCGCCTTCTTCATCACCGTCGGGTACTGGCAGCGAGACGCCGCCGCCGGTGGGTTCTCGATCTTCCGGCGGGCTTTTCCGCTGCGGCAGCTTCCCAAGCTACGACCGGTGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767506.1
MVETLTPTSSPPCFWRRSAANHHHHHRRWIPAAFVFFLSTHKTFLTALCLAFFITVGYWQRDAAAGGFSIFRRAFPLRQLPKLRPVAFNLTDFGGVGDGVTLNTVAFEKAVMAISKLGKKGGGQLNVPPGNWLTAPFNLTSHMTLFLAEGAVILGIDDEKYWPLMPPLPSYGYGREHPGPRYGSLIHGQHLKDVTITGHNGTINGQGQAWWKKYRQKLLNHTRGPLVQIMWSSNILISNITLRDSPFWTLHPYDCKNVTI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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